More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0070 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0200  protein synthesis factor GTP-binding protein  75 
 
 		 533 aa  808    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1155  protein synthesis factor GTP-binding  75.92 
 
 		 545 aa  824    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0070  protein synthesis factor GTP-binding  100 
 
 		 540 aa  1063    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1813  protein synthesis factor GTP-binding  72.94 
 
 		 557 aa  800    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.133503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2206  protein synthesis factor GTP-binding protein  74.91 
 
 		 551 aa  781    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0642  translation elongation factor 1A GTP binding subunit  33.83 
 
 		 520 aa  289  9e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.111527  normal  0.300647 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0233  protein synthesis factor GTP-binding protein  33.58 
 
 		 523 aa  283  5.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0137  elongation factor Tu domain-containing protein  35.16 
 
 		 524 aa  266  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29069  predicted protein  34.72 
 
 		 594 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0832237  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10003  GTP binding protein (GTPBP1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12580)  31.7 
 
 		 622 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1723  protein synthesis factor, GTP-binding  34.02 
 
 		 519 aa  236  7e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.649328 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0756  protein synthesis factor, GTP-binding  35.1 
 
 		 517 aa  227  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9185  predicted protein  31.75 
 
 		 541 aa  226  7e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0547  translation elongation factor 1A GTP binding subunit  33.83 
 
 		 520 aa  224  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0741  protein synthesis factor GTP-binding  33.79 
 
 		 519 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04780  GTP-binding protein 1 (g-protein 1), putative  27.29 
 
 		 623 aa  192  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  32.33 
 
 		 400 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  31.72 
 
 		 395 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  31.29 
 
 		 399 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  31.29 
 
 		 399 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  30.7 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  30.91 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  30.82 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  31.07 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  30.84 
 
 		 399 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  30.5 
 
 		 397 aa  148  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  30.5 
 
 		 397 aa  148  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  31.01 
 
 		 399 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  30.52 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  30.52 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  30.18 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  30.18 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  29.66 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  29.66 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  31.24 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  31.31 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  31.31 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  31.24 
 
 		 397 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  31.63 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  31.24 
 
 		 397 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.07 
 
 		 627 aa  144  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  31.25 
 
 		 400 aa  143  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  31.25 
 
 		 400 aa  143  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  31 
 
 		 400 aa  143  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  29.04 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  30.02 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  30.02 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  30.02 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  30.02 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  31.41 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  31.4 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  30.3 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  30.3 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  30.95 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  29.68 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  29.68 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  29.98 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  29.98 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  31.12 
 
 		 399 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  30.66 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  31.07 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  31.07 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  29.18 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  29.18 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  29.72 
 
 		 394 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  29.8 
 
 		 400 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.96 
 
 		 634 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  29.8 
 
 		 400 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  29.66 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  30.45 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  29.29 
 
 		 396 aa  137  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  28.39 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  29.29 
 
 		 396 aa  137  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  27.63 
 
 		 394 aa  137  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  29.56 
 
 		 400 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  30.56 
 
 		 400 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  30.79 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  30.79 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  29.76 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0997  elongation factor Tu  28.7 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000193617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_869  translation elongation factor  28.7 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000280578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.63 
 
 		 636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  29.14 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  29.98 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  29.14 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  30.52 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  30.43 
 
 		 395 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0888  elongation factor Tu  28.7 
 
 		 400 aa  135  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000621917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4088  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.23 
 
 		 614 aa  135  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.27 
 
 		 633 aa  135  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  29.52 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0884  elongation factor Tu  30.32 
 
 		 409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.669879  hitchhiker  0.000241501 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  30.21 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.66 
 
 		 605 aa  134  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4961  selenocysteinyl-tRNA-specific translation factor  33.23 
 
 		 614 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  29.3 
 
 		 397 aa  134  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2191  elongation factor Tu  29.75 
 
 		 396 aa  134  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  29.64 
 
 		 395 aa  134  6e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2203  elongation factor Tu  29.75 
 
 		 396 aa  134  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000805833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  28.31 
 
 		 395 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>