More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0888 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0997  elongation factor Tu  98.25 
 
 
400 aa  815    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000193617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0888  elongation factor Tu  100 
 
 
400 aa  820    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000621917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_869  translation elongation factor  99.5 
 
 
400 aa  818    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000280578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  71.68 
 
 
400 aa  616  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  71.18 
 
 
400 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  71.93 
 
 
400 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  71.11 
 
 
400 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  71.11 
 
 
400 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  71 
 
 
400 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  71.68 
 
 
400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  71.93 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  71.61 
 
 
399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  71.11 
 
 
400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  71.11 
 
 
400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  71.11 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  71.61 
 
 
400 aa  600  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  69.92 
 
 
400 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  71.18 
 
 
397 aa  593  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  71.18 
 
 
397 aa  593  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  70.18 
 
 
400 aa  589  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  70.18 
 
 
400 aa  589  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  69.67 
 
 
396 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  69.67 
 
 
396 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  69.67 
 
 
396 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  69.67 
 
 
396 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  68.17 
 
 
400 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  67.67 
 
 
400 aa  574  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  67.67 
 
 
395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  69.42 
 
 
399 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  68.67 
 
 
396 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  67.17 
 
 
396 aa  567  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  68.67 
 
 
396 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  69.17 
 
 
399 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  66.67 
 
 
394 aa  565  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  66.34 
 
 
405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  68.42 
 
 
397 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  66.42 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  68.92 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  69.92 
 
 
400 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  66.25 
 
 
396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0495  elongation factor Tu  68.92 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0610373  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  66.34 
 
 
405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  66.67 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  66.42 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  66.42 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  68.42 
 
 
397 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  69.92 
 
 
400 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  66.42 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  65.66 
 
 
399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0483  elongation factor Tu  68.92 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000918892  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  68.92 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4913  elongation factor Tu  69 
 
 
400 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00837266  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  66.42 
 
 
395 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  68.75 
 
 
400 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  65.5 
 
 
399 aa  558  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  69.67 
 
 
396 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  69.67 
 
 
396 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  65.91 
 
 
396 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  65.91 
 
 
396 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  66.42 
 
 
396 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  68.5 
 
 
400 aa  558  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  66.58 
 
 
397 aa  560  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  65.84 
 
 
397 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0118  elongation factor Tu  69 
 
 
400 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0332354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  68.75 
 
 
400 aa  560  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  66.92 
 
 
396 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  66.92 
 
 
396 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  65 
 
 
399 aa  554  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  64.5 
 
 
399 aa  555  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  66.08 
 
 
397 aa  554  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  65.91 
 
 
397 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  67.83 
 
 
396 aa  556  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  68.08 
 
 
396 aa  557  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  66.92 
 
 
396 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  65.66 
 
 
396 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  65.66 
 
 
396 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  65.09 
 
 
397 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  64.66 
 
 
399 aa  554  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  66 
 
 
399 aa  553  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  65.66 
 
 
395 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  64.66 
 
 
399 aa  554  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  66.17 
 
 
396 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  66.67 
 
 
395 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  67 
 
 
400 aa  551  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  66.92 
 
 
396 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1187  elongation factor Tu  70 
 
 
401 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  65.66 
 
 
395 aa  552  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  66.17 
 
 
396 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  66.92 
 
 
400 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  65.84 
 
 
397 aa  551  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  64.66 
 
 
399 aa  554  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  66.83 
 
 
395 aa  551  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1479  elongation factor Tu  70.75 
 
 
401 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.008881  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  66.25 
 
 
396 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  66.5 
 
 
396 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  67.33 
 
 
395 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3026  elongation factor Tu  70.75 
 
 
401 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  65 
 
 
394 aa  548  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  65.58 
 
 
396 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  66.25 
 
 
396 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>