217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0812 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0812  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  809    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.217299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4508  hypothetical protein  58.58 
 
 		 408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0873  hypothetical protein  58.09 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250063  hitchhiker  0.0000000169408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  54.74 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4254  protein of unknown function UPF0027  55.28 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3081  protein of unknown function UPF0027  53.19 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  37.76 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  36.83 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  34.91 
 
 		 470 aa  200  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  34.94 
 
 		 473 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  35.52 
 
 		 440 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  33.94 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  33 
 
 		 508 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0086  protein of unknown function UPF0027  32.18 
 
 		 484 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  34.34 
 
 		 474 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  34.28 
 
 		 475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  33.08 
 
 		 463 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  30.37 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  33.92 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  32.67 
 
 		 512 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  34.5 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  33.83 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  32.38 
 
 		 384 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  32.41 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7273  protein of unknown function UPF0027  31.68 
 
 		 478 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000026234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  31.22 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  31.92 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  28.68 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  31.04 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  30.9 
 
 		 395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  30.71 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  31.66 
 
 		 398 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  29.06 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  28.57 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  28.4 
 
 		 408 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  32.17 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  29.06 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  31.44 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  29.09 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  28.81 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  28.81 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  30.1 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  28.81 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  28.81 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  30.17 
 
 		 411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  32.63 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  30.22 
 
 		 407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  30.27 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  29.3 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  28.16 
 
 		 405 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  32.1 
 
 		 407 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  30 
 
 		 406 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  30.33 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  29.8 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  29.78 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  28.16 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  32.35 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  29.44 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  29.97 
 
 		 393 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  30.17 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  31.41 
 
 		 484 aa  143  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  29.43 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  27.92 
 
 		 405 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  30.02 
 
 		 404 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  29.28 
 
 		 401 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  31.3 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  30.3 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  28.68 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  31.03 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  31.56 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  31.56 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  28.82 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  30.26 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  30.1 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  29.89 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  30.95 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  29.21 
 
 		 408 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  28.68 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  28.28 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  30.89 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  30.75 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  30.32 
 
 		 498 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  27.67 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  29.91 
 
 		 477 aa  133  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  28.41 
 
 		 478 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  31.11 
 
 		 484 aa  132  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  28.37 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  29.59 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  28.95 
 
 		 500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  28.73 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  29.63 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  30.41 
 
 		 477 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  30.97 
 
 		 477 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  28.1 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  28.08 
 
 		 482 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  29.35 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  30.94 
 
 		 480 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  30.47 
 
 		 486 aa  126  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  28.44 
 
 		 480 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>