More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2477 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  77.48 
 
 		 264 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  65.28 
 
 		 267 aa  343  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  66.04 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  63.77 
 
 		 267 aa  339  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  69.08 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  61.3 
 
 		 265 aa  300  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  50 
 
 		 272 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  54.92 
 
 		 271 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  54.92 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  50.56 
 
 		 277 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  54.75 
 
 		 272 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  51.14 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  50.76 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  55.3 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 		 262 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  50.37 
 
 		 278 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  51.52 
 
 		 270 aa  244  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  46.01 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  45.04 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  52.65 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  50.76 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  46.01 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  50.82 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 269 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  47.58 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  52.32 
 
 		 269 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  49.05 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  48.13 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  43.77 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  45.63 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  51.64 
 
 		 263 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 266 aa  238  6.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  55.3 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  55.3 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  55.3 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  55.3 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  55.3 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  55.3 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  55.3 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  51.27 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  52.05 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 268 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  52.05 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  48.88 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  48.5 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  51.34 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  51.05 
 
 		 279 aa  235  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  47.39 
 
 		 269 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  45.32 
 
 		 268 aa  234  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  48.51 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  47.99 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  47.19 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  51.27 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  50.63 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  47.19 
 
 		 285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  48.11 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  49.59 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  52.26 
 
 		 268 aa  232  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  43.4 
 
 		 267 aa  232  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  48.11 
 
 		 265 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  49.81 
 
 		 265 aa  231  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  45.8 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  53.79 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  51.89 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  46.21 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  52.19 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  47.73 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  47.68 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  46.56 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  48.95 
 
 		 279 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  48.56 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  46.62 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  50.38 
 
 		 272 aa  228  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  44.15 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 279 aa  228  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  45.63 
 
 		 285 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  46.07 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  46.01 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  46.88 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  47.43 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>