More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0617 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 174 aa  347  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  87.93 
 
 		 174 aa  314  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  78.16 
 
 		 174 aa  276  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  73.84 
 
 		 173 aa  261  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  73.84 
 
 		 173 aa  261  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  71.26 
 
 		 174 aa  254  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  68.97 
 
 		 174 aa  248  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  57.23 
 
 		 172 aa  197  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  50 
 
 		 174 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  48.54 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  52.98 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  47.4 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  49.42 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  48.24 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  48.84 
 
 		 172 aa  150  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  47.74 
 
 		 166 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  47.74 
 
 		 166 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  46.34 
 
 		 178 aa  144  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  43.53 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  44.87 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 174 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  46.39 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  44.05 
 
 		 176 aa  137  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  44.58 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  46.51 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  42.77 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  40 
 
 		 176 aa  134  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  47.06 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  47.73 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  45.21 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  47.06 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  40.24 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  42.2 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  45.77 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 181 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  43.05 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  39.62 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  41.28 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  48.89 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  34.1 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  43.14 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  41.67 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  41.28 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  35.63 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  38.89 
 
 		 176 aa  107  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  41.1 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  41.42 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  38.69 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  45.71 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  43.97 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  38.29 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 212 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  37.79 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>