192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2958 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  100 
 
 		 286 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  46.07 
 
 		 449 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  47.51 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  47.84 
 
 		 453 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  45.14 
 
 		 446 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  47.62 
 
 		 397 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  45.53 
 
 		 446 aa  232  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  43.5 
 
 		 479 aa  208  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  36.8 
 
 		 425 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  37.64 
 
 		 450 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  36.96 
 
 		 473 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  34.89 
 
 		 451 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  36.23 
 
 		 452 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  33.72 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  34.33 
 
 		 447 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  34.26 
 
 		 487 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  33.21 
 
 		 439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  31.32 
 
 		 499 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  34.03 
 
 		 472 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  35.71 
 
 		 422 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  34.17 
 
 		 460 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  34.66 
 
 		 561 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 		 459 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  30.2 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  28 
 
 		 424 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  31.28 
 
 		 434 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  31.52 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  30.59 
 
 		 320 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  30.5 
 
 		 408 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 422 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  30.31 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  31.25 
 
 		 451 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  32.17 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  32.17 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  28.19 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  28.9 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  30.42 
 
 		 447 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  31.56 
 
 		 432 aa  99.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  29.66 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  29.66 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  29.5 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  29.13 
 
 		 538 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  30.45 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  29.28 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  31.28 
 
 		 439 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  28.08 
 
 		 323 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  31.72 
 
 		 417 aa  95.9  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  30.86 
 
 		 439 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  32.11 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  29.66 
 
 		 427 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  30.45 
 
 		 429 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  31.27 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  30.77 
 
 		 425 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  30.8 
 
 		 445 aa  92.4  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  30.54 
 
 		 444 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  32.3 
 
 		 427 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  26.55 
 
 		 433 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  28.63 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  28.24 
 
 		 525 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  28.24 
 
 		 525 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  26.05 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  28.8 
 
 		 443 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  23.02 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  28.4 
 
 		 443 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  26.84 
 
 		 412 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  25.97 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  30.56 
 
 		 429 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  29.43 
 
 		 424 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  28.03 
 
 		 437 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  28.03 
 
 		 437 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  27.44 
 
 		 411 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  27.78 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  28.03 
 
 		 437 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  28.03 
 
 		 437 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  30.63 
 
 		 448 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  27.63 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  27.63 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  27.64 
 
 		 412 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 439 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  32.95 
 
 		 441 aa  86.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  28.03 
 
 		 437 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  27.44 
 
 		 411 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  29.08 
 
 		 403 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  30.21 
 
 		 429 aa  85.9  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 297 aa  85.5  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>