202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1985 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  100 
 
 		 264 aa  539  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  41.67 
 
 		 221 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  40.82 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  41.75 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  38.66 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  39.3 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  38.27 
 
 		 229 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  37.76 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  37.62 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  39.8 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  38.66 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  37.63 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  37.63 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  36.46 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  31.79 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  35.23 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  33.33 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1749  OmpW family protein  34.98 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  32.71 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  32.71 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  32.71 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  32.71 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  32.71 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  30.88 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  33.49 
 
 		 224 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2085  OmpW family protein  33.33 
 
 		 226 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  hitchhiker  0.00113092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  33 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  29.3 
 
 		 228 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  33.5 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  31.31 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  31.4 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  31.78 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  31.68 
 
 		 219 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  30.3 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  31.4 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  31.4 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  31.4 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  30.12 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  31.53 
 
 		 215 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  32.29 
 
 		 214 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  33.82 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  32.29 
 
 		 194 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  32.29 
 
 		 194 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1545  OmpW family protein  33.33 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281829  normal  0.0125909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  31.5 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  31.79 
 
 		 202 aa  95.1  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  31.19 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  29.35 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  27.83 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  31.84 
 
 		 204 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  30.29 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  34.59 
 
 		 195 aa  85.5  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  34.59 
 
 		 195 aa  85.5  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  31.12 
 
 		 208 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  32.91 
 
 		 214 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  32.2 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  31.63 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  28.72 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  36.26 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  35.03 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  36.26 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  31.12 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  29.06 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  32.28 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  29.9 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2378  putative outer membrane protein  33.76 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1732399999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  26.17 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  29.11 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  32.75 
 
 		 200 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1677  OmpW  31.71 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  28.57 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  27.59 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  28.57 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  26.79 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  26.24 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  28.85 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  31.71 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  31.71 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  27.59 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  29.29 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  28.64 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  29.29 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  29.76 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  28.57 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  27.96 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  26.79 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  31.37 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  28.22 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  29.65 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  28.22 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  30.97 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  31.45 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  27.36 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  25.97 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  28.93 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  28.93 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  31.45 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  31.45 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  32.05 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>