151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2378 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2378  putative outer membrane protein  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1732399999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  36.68 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  33.33 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  33.5 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  32.43 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  34.64 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  30.66 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  33.76 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  29.49 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  31.72 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  31.67 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  28.1 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  28.26 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  28.92 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  30.94 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  32.72 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  29.63 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  29.18 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  32.54 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  31.95 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  26.63 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  29.19 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  36.59 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  29.28 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  29.83 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  29.25 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  29.36 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  27.65 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  31.61 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  31.28 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  28.73 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  29.94 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  31.21 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  29.94 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  31.63 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  27.71 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  34.23 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  35.06 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  29.41 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  31.21 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  27.14 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  29.91 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  29.82 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  31.05 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  31.05 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  31.41 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  30.06 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  30.38 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  27.31 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  30.06 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  29.35 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  24.77 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  29.3 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  29.3 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  32.26 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  27.43 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  27.63 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  28.57 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  27.43 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  29.3 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  32.43 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  32.43 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  32.43 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  33.33 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  32.43 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  32.43 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  27.27 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  31.51 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  27.63 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  30.49 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  24.88 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  32.43 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  27.43 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  32.31 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  31.06 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  30.72 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  28.31 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  27.27 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  29.38 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  28.31 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  29.07 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  28.44 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  28.44 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  28.97 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  25.99 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  25.99 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  25.99 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  25.99 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  25.99 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  28.37 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  29.68 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  25.99 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  25.99 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  28.7 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  30.82 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  26.09 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  28.31 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  27.85 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  31.76 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>