More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2334 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  100 
 
 		 163 aa  323  7e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  62.5 
 
 		 165 aa  177  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  52.94 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  52.94 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  52.94 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  54.93 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  55.56 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  53.62 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  48.23 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  49.29 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  44.29 
 
 		 138 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  48.53 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  46.43 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  48.15 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  47.83 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  47.79 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  45.65 
 
 		 136 aa  120  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  44.93 
 
 		 138 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  48.85 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  44.93 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  42.75 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  45.99 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  44.62 
 
 		 136 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  42.22 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  44.12 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  44.7 
 
 		 137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  43.38 
 
 		 136 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  43.61 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  41.91 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  41.91 
 
 		 138 aa  103  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  38.3 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  41.33 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  37.69 
 
 		 190 aa  92.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  37.88 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  37.4 
 
 		 133 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  39.39 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  43.97 
 
 		 135 aa  87.8  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 140 aa  87.8  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14710  transcription antitermination factor NusB  38.35 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  39.1 
 
 		 195 aa  87  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  35.56 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  38.85 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  50 
 
 		 135 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  38.64 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  48.19 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  31.25 
 
 		 156 aa  84  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  46.99 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  32.12 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  36.59 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  33.59 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  34.62 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  31.39 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  42.06 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  32.61 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  31.82 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  35 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  41.11 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  31.78 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  34.27 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  31.85 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  31.88 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  29.93 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  32.71 
 
 		 134 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  28.99 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  32.84 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  36.57 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  32.58 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  32.58 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  31.01 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  29.93 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  34.59 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  33.59 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  38.64 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  31.82 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  31.82 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  31.82 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  31.82 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0822  transcription antitermination protein NusB  35.33 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.932634  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  31.82 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  31.82 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  31.82 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  31.82 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  40.24 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  38.82 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0750  transcription termination factor  29.77 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.906803  hitchhiker  0.00118755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>