191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1923 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  100 
 
 
692 aa  1367    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.74 
 
 
1919 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  42.71 
 
 
1657 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  46.67 
 
 
1679 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  50.51 
 
 
461 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  47.62 
 
 
461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.33 
 
 
821 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.06 
 
 
818 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  43.87 
 
 
911 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  42.25 
 
 
547 aa  159  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  42.79 
 
 
449 aa  158  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  42.42 
 
 
2082 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  38.28 
 
 
807 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  42.8 
 
 
1222 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  39.68 
 
 
469 aa  138  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  36.87 
 
 
551 aa  134  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  41.97 
 
 
717 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  40.37 
 
 
784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  37.65 
 
 
714 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.45 
 
 
706 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  35.79 
 
 
726 aa  127  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.46 
 
 
554 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  39.45 
 
 
778 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  39.2 
 
 
593 aa  124  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  32.6 
 
 
776 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.51 
 
 
837 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.84 
 
 
417 aa  122  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  38.99 
 
 
792 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  36.61 
 
 
743 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  34.04 
 
 
376 aa  120  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.09 
 
 
570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.75 
 
 
561 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  38.64 
 
 
546 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.18 
 
 
555 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.39 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  35.91 
 
 
558 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  36.77 
 
 
403 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  28.21 
 
 
363 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.59 
 
 
563 aa  114  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.17 
 
 
567 aa  114  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  28.21 
 
 
363 aa  113  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  38.32 
 
 
1129 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  35.78 
 
 
477 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  35.91 
 
 
560 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  34.55 
 
 
569 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  34.26 
 
 
554 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.12 
 
 
556 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  37.95 
 
 
681 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.3 
 
 
1126 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.01 
 
 
810 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  32.87 
 
 
579 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.87 
 
 
555 aa  104  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.44 
 
 
1848 aa  104  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  35.78 
 
 
577 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  33.97 
 
 
737 aa  101  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  37.31 
 
 
566 aa  101  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  33.33 
 
 
835 aa  100  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  29.89 
 
 
1951 aa  99  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  29.96 
 
 
558 aa  97.4  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  32.43 
 
 
553 aa  97.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  33.17 
 
 
375 aa  94.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  31.22 
 
 
618 aa  94.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  37.37 
 
 
602 aa  94  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.39 
 
 
787 aa  91.3  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  35.44 
 
 
443 aa  90.9  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  34.4 
 
 
389 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.88 
 
 
817 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  33.16 
 
 
597 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  29.77 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  33.02 
 
 
558 aa  85.5  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  29.86 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1474  hypothetical protein  49.51 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  29.41 
 
 
396 aa  84  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.67 
 
 
941 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  33.33 
 
 
1207 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  29.57 
 
 
2117 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 
745 aa  82.4  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  29.54 
 
 
1187 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  39.8 
 
 
106 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  35.25 
 
 
1312 aa  79.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  43.33 
 
 
1201 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.74 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.06 
 
 
900 aa  78.2  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  31.45 
 
 
499 aa  77.4  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 
624 aa  76.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  45.83 
 
 
979 aa  76.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  28.34 
 
 
638 aa  75.1  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  29.19 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.15 
 
 
921 aa  73.9  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.02 
 
 
2816 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  27.92 
 
 
643 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  30.38 
 
 
1096 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  42.86 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  31.06 
 
 
575 aa  71.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  33.52 
 
 
544 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  35.46 
 
 
3562 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  26.61 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  27.31 
 
 
643 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.51 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  28.79 
 
 
394 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>