More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3229 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  100 
 
 		 229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.77 
 
 		 223 aa  315  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2295  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 218 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  36.15 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  38.25 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.01 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  37.79 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  37.09 
 
 		 215 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 216 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3299  LuxR response regulator receiver  36.11 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0158345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 206 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 212 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 219 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3526  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134281  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.7 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  38.21 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 206 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  35.62 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  35.48 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.7 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  35.51 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  34.27 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  34.27 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  32.26 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>