More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7276 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.66 
 
 		 368 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  50 
 
 		 457 aa  258  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  51.17 
 
 		 300 aa  255  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  51.96 
 
 		 330 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  51.69 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  50.68 
 
 		 311 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.3 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  48.16 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  46.33 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  46.33 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  46.33 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.65 
 
 		 324 aa  231  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  45.15 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  44.82 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  45.48 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  45.48 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  44.05 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.92 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  44.67 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.51 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  44.82 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  43.81 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  43.58 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  55.3 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  43.81 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  45.97 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  46.78 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  44.26 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  42.42 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  44.48 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  41.54 
 
 		 361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  42.47 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  42.38 
 
 		 348 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  44.52 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  47.3 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  44.3 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.74 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  58.74 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  46.86 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  41.75 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  53.47 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  40.88 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  43.48 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  44.52 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  40.68 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  41.75 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  42.9 
 
 		 368 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  44.26 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  43.73 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  54.05 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 234 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  43.42 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  48.32 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  44.52 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  38.72 
 
 		 314 aa  205  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  45 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  42.38 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.43 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  45.27 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 337 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  45.12 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  45.12 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  51.8 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  54.03 
 
 		 242 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  40.67 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 496 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.17 
 
 		 252 aa  195  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  43.23 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  54.84 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  42.67 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  54.46 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  44.48 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  41.69 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  45 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.2 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  43.96 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  52.89 
 
 		 232 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  43.85 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.39 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  37.16 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  39.73 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  40.2 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>