More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3723 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 281 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  55.22 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0929  alpha/beta hydrolase fold  55.22 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.345522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3470  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304783  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  54.24 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.6 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  40.46 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  30.65 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  36.09 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  36.15 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  31.03 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  37.61 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  35.46 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1389  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  34.35 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  30.06 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  30.54 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.78 
 
 		 2762 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  27.72 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4072  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  33.65 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  37.37 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.28 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  45.71 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2685  Alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  34.35 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2097  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  33.59 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  35.34 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1620  hypothetical protein  32.64 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  32.16 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  39.2 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  41.43 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>