More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1685 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  42.96 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  34.27 
 
 		 214 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  33.57 
 
 		 214 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  38.1 
 
 		 218 aa  93.6  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  36.92 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  37.69 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  37.98 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  34.01 
 
 		 228 aa  87  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  34.53 
 
 		 219 aa  86.3  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  29.37 
 
 		 210 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  36.89 
 
 		 222 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  33.59 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  35.11 
 
 		 219 aa  85.1  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 		 219 aa  84.3  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  30.16 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  35.88 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  31.97 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  29.01 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  33.91 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  37.98 
 
 		 617 aa  77.4  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  32.06 
 
 		 225 aa  77  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  36.69 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.77 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  27.48 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  27.78 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  32.37 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  28.57 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  35.09 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  29.01 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  31.97 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  28.81 
 
 		 264 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  28.97 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  34.35 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  29.5 
 
 		 219 aa  73.9  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  28.46 
 
 		 220 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  28.24 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  26.28 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  24.46 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  26.81 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  30.46 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  33.59 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  33.59 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  37.39 
 
 		 630 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  25.19 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  25.19 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  26.81 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  26.92 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  37.93 
 
 		 628 aa  70.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  30.22 
 
 		 462 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  25.36 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  25.18 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  25.55 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  28.68 
 
 		 218 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  28.93 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4120  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  25.95 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  28.57 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  33.06 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  27.34 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  31.16 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  25.19 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  25.36 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  27.82 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  26.98 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  31.11 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  28.15 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  30.37 
 
 		 458 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  31.11 
 
 		 458 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  34.17 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  31.69 
 
 		 457 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  34.41 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  25.98 
 
 		 234 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  25.19 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  33.05 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  26.19 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  32.76 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  29.77 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  30.87 
 
 		 459 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  30.37 
 
 		 458 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  33.88 
 
 		 445 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  27.35 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  29.63 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  31.85 
 
 		 458 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4544  potassium transporter peripheral membrane component  30.52 
 
 		 492 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 458 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>