More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1058 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  73.75 
 
 
240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  68.49 
 
 
242 aa  332  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  69.33 
 
 
242 aa  331  5e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  61.67 
 
 
240 aa  325  5e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  61.67 
 
 
240 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  61.25 
 
 
240 aa  320  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.5 
 
 
244 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  64.58 
 
 
246 aa  315  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  62.92 
 
 
242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.92 
 
 
249 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  62.5 
 
 
240 aa  308  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  58.43 
 
 
256 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.54 
 
 
273 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  61.16 
 
 
245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  60.83 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.92 
 
 
244 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  59.5 
 
 
247 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60.67 
 
 
245 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.42 
 
 
244 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60.83 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  60.67 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  62.5 
 
 
240 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  58.75 
 
 
243 aa  301  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.92 
 
 
244 aa  300  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  58.26 
 
 
243 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.08 
 
 
240 aa  299  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  60.25 
 
 
249 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  54.72 
 
 
267 aa  299  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  299  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  62.08 
 
 
242 aa  299  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  59.83 
 
 
239 aa  299  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  61.25 
 
 
242 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58.78 
 
 
253 aa  298  8e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  57.92 
 
 
252 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  59.5 
 
 
246 aa  297  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  61.83 
 
 
241 aa  296  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.65 
 
 
260 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.74 
 
 
244 aa  297  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.58 
 
 
244 aa  297  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  56.8 
 
 
260 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  56.67 
 
 
251 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.78 
 
 
246 aa  296  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59.67 
 
 
247 aa  296  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.17 
 
 
278 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  58.54 
 
 
247 aa  296  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.41 
 
 
246 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.42 
 
 
244 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
254 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  60.83 
 
 
243 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
244 aa  295  4e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  60.83 
 
 
253 aa  295  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  58.78 
 
 
246 aa  295  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  60 
 
 
240 aa  295  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  60.42 
 
 
240 aa  295  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 
253 aa  294  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  59.17 
 
 
242 aa  294  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  59.17 
 
 
240 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  293  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.74 
 
 
241 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  52.59 
 
 
256 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  57.92 
 
 
244 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  292  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 
240 aa  292  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
284 aa  292  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  292  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  58.75 
 
 
240 aa  292  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.92 
 
 
242 aa  292  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  58.57 
 
 
254 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  291  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  58.57 
 
 
250 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  58.17 
 
 
250 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
241 aa  291  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  57.5 
 
 
242 aa  291  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
240 aa  291  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  59.27 
 
 
249 aa  291  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  57.92 
 
 
242 aa  291  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  58.51 
 
 
247 aa  291  8e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.5 
 
 
242 aa  291  8e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  291  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  60 
 
 
243 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  61 
 
 
255 aa  290  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.38 
 
 
248 aa  290  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  60.83 
 
 
243 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  58.75 
 
 
241 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  58.4 
 
 
255 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  58.58 
 
 
247 aa  290  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  61.25 
 
 
243 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  57.85 
 
 
251 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  59.68 
 
 
263 aa  289  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  57.08 
 
 
241 aa  289  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  56.45 
 
 
254 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  57.92 
 
 
240 aa  289  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 
241 aa  288  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>