More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2438 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  78.8 
 
 		 218 aa  375  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  75.49 
 
 		 209 aa  343  8.999999999999999e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  72.35 
 
 		 237 aa  338  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  71.35 
 
 		 227 aa  300  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  56.42 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  62.89 
 
 		 217 aa  258  7e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  60.29 
 
 		 216 aa  254  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  60.29 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  59.41 
 
 		 212 aa  252  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  60.42 
 
 		 217 aa  251  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  59.31 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  58.82 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  57.22 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  57.22 
 
 		 217 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  54.41 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  57.81 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  53.65 
 
 		 217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.3 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  46.28 
 
 		 211 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0069  endonuclease III  46.91 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  47.8 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  41.15 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  43.96 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  44.26 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  41.15 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  40.62 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  40.62 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  40.62 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  40.62 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  43.98 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  40.62 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  40.62 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  39.38 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  40.41 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  43.68 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.96 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  39.58 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  40.1 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  44.26 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  44.26 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  40.1 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  40.51 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  43.26 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  39.51 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  40 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  42.41 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  40.32 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.58 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  40.86 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  40.76 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  41.81 
 
 		 197 aa  148  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  38.22 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  42.7 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.41 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  42.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  41.57 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  42.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  42.41 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.39 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.88 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  41.36 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  41.36 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  41.88 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  39.79 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  45.55 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.78 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.78 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  38.1 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  41.36 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  42.41 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  41.36 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  41.36 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  41.88 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  41.36 
 
 		 213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  41.88 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.36 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  36.98 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  41.36 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  41.36 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  41.88 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  41.95 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  41.36 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  44.2 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  39.89 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  41.36 
 
 		 213 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  40.84 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  41.88 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  40.84 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  37.37 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  39.79 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.8 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  39.25 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.57 
 
 		 277 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>