More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0037 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  71.62 
 
 		 435 aa  641    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  68.27 
 
 		 461 aa  648    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  907    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  67.81 
 
 		 441 aa  626  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  63.62 
 
 		 443 aa  570  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  42.48 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  39.28 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  41.71 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  41.71 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  41.71 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  41.99 
 
 		 445 aa  329  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  42.51 
 
 		 445 aa  328  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  41.99 
 
 		 447 aa  328  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 		 445 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  41.5 
 
 		 442 aa  326  6e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  36.92 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  35.96 
 
 		 435 aa  296  3e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  36.1 
 
 		 443 aa  294  3e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  37.28 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  37.28 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  36.09 
 
 		 448 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  35.19 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  32.11 
 
 		 439 aa  209  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  31.31 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.86 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  25.95 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 		 380 aa  116  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.95 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  27.59 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  24.15 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  24.94 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  26.41 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.67 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  27.5 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  27.5 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  25.32 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.99 
 
 		 384 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.35 
 
 		 422 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  25.83 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  32.99 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.06 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  23.7 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  23.97 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0241  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  33.66 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  22.03 
 
 		 484 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12413  coproporphyrinogen III oxidase  25.31 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000120339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.13 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.93 
 
 		 372 aa  103  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  23.97 
 
 		 379 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  24.38 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.55 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.41 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  23.65 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  23.45 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.9 
 
 		 466 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  25.95 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.06 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3781  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase family protein  26.43 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.27 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.3 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1376  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.43 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0263  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.34 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.46476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  23.91 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  23.98 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  24.43 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.85 
 
 		 393 aa  100  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  23.45 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  23.45 
 
 		 378 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  25.43 
 
 		 460 aa  99.8  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  23.64 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.4 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  23.2 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.51 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.47 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0380  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.42 
 
 		 379 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.69 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  30.69 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.93 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  23.39 
 
 		 379 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.55 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.44 
 
 		 412 aa  97.8  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  30.59 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  22.37 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.16 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  24.63 
 
 		 465 aa  97.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  24.04 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  25.19 
 
 		 398 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.19 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.02 
 
 		 381 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.18 
 
 		 457 aa  96.7  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.56 
 
 		 406 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.54 
 
 		 378 aa  96.3  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>