More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0412 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
456 aa  928    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  80.09 
 
 
443 aa  733    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  98.65 
 
 
448 aa  892    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  57.34 
 
 
454 aa  525  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  56.65 
 
 
454 aa  520  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  59.81 
 
 
435 aa  513  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  56.83 
 
 
424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  47.41 
 
 
421 aa  378  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  41.06 
 
 
445 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  41.06 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  40.58 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  40.58 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  40.58 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  40.58 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
445 aa  335  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
445 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
445 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  40.58 
 
 
447 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
445 aa  335  9e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  42.82 
 
 
442 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  42.6 
 
 
444 aa  332  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  40.34 
 
 
445 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  35.19 
 
 
438 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  32.01 
 
 
461 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  34.23 
 
 
443 aa  266  5e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  34.87 
 
 
441 aa  266  7e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  34.66 
 
 
435 aa  265  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  33.51 
 
 
439 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  33.88 
 
 
428 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.48 
 
 
384 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.76 
 
 
381 aa  120  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.69 
 
 
380 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  27.67 
 
 
374 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 
372 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.8 
 
 
414 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.21 
 
 
380 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 
443 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.1 
 
 
378 aa  106  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.07 
 
 
432 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.5 
 
 
401 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.13 
 
 
371 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.69 
 
 
360 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  30.38 
 
 
379 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  26.81 
 
 
378 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  28.77 
 
 
378 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  29.01 
 
 
379 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  26.5 
 
 
376 aa  103  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  28.77 
 
 
378 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  28.77 
 
 
379 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  28.77 
 
 
378 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  28.67 
 
 
379 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  28.77 
 
 
378 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  28.91 
 
 
379 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 
382 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.61 
 
 
388 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.22 
 
 
371 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  28.42 
 
 
379 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.96 
 
 
374 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  25.27 
 
 
385 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.27 
 
 
385 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  26.18 
 
 
377 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.69 
 
 
376 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  29.28 
 
 
382 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.99 
 
 
375 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  26.05 
 
 
377 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  25.27 
 
 
386 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1716  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.06 
 
 
384 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.871197  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  27.6 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.9 
 
 
385 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  28.42 
 
 
378 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.96 
 
 
389 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.92 
 
 
378 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.84 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.21 
 
 
368 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  29.93 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5773  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.77 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  28.28 
 
 
396 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.52 
 
 
387 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  26.76 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  26.47 
 
 
409 aa  97.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  22.56 
 
 
411 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0241  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  23.89 
 
 
379 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  26.84 
 
 
409 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1379  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.71 
 
 
351 aa  96.3  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000560145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.16 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.63 
 
 
382 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  22.84 
 
 
409 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  23.67 
 
 
379 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0222  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.04 
 
 
371 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.08 
 
 
374 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  23.92 
 
 
393 aa  95.5  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.54 
 
 
377 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  25.62 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0631  coproporphyrinogen III oxidase  28.12 
 
 
501 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.74 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  24.64 
 
 
407 aa  94.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.29 
 
 
378 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.67 
 
 
381 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.93 
 
 
448 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>