More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4806 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  90.56 
 
 		 445 aa  854    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  90.79 
 
 		 445 aa  856    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  91.24 
 
 		 445 aa  863    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  91.46 
 
 		 445 aa  862    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  95.73 
 
 		 445 aa  899    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  90.34 
 
 		 442 aa  844    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  90.56 
 
 		 445 aa  854    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  90.79 
 
 		 445 aa  855    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 445 aa  931    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  93.02 
 
 		 447 aa  872    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  91.24 
 
 		 445 aa  862    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  91.24 
 
 		 445 aa  862    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  84.94 
 
 		 445 aa  803    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  91.24 
 
 		 445 aa  863    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  82.75 
 
 		 444 aa  762    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  42.65 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  40.09 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  42.38 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  42.53 
 
 		 421 aa  332  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  40.62 
 
 		 443 aa  332  1e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  42.51 
 
 		 438 aa  328  8e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 		 456 aa  323  4e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  37.94 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  39.9 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  39.45 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  38.76 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  36.87 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.86 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.56 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  26.98 
 
 		 379 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  26.98 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.53 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.27 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  26.39 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  26.39 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  26.39 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  26.39 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  26.39 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  26.39 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  26.39 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.19 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.87 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  25.93 
 
 		 379 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.36 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  26.03 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.32 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.75 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  25.66 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  29.03 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.55 
 
 		 378 aa  116  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1654  coproporphyrinogen III oxidase  27.4 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.58488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  28.76 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  25.75 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  26.78 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  25.75 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.21 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.49 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.41 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.03 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  26.79 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  26.26 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  26.93 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.72 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  24.09 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.94 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.49 
 
 		 411 aa  110  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  25.56 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  24.57 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.4 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.69 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.72 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1240  coproporphyrinogen III oxidase  25.56 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000912695  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0781  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.4 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.41975  normal  0.123732 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  27.7 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.15 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  27.25 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  26.55 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  27.7 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  24.38 
 
 		 460 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  25.55 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.24 
 
 		 357 aa  104  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  25.38 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2770  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.44 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.95 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  25.39 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3486  coproporphyrinogen III oxidase  25.64 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.55 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.53 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.68 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.32 
 
 		 460 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.55 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  24.69 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.49 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  24.38 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.28 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>