More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1666 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
435 aa  890    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  61.68 
 
 
443 aa  537  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  58.58 
 
 
454 aa  526  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  57.44 
 
 
454 aa  519  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  60.28 
 
 
448 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  59.81 
 
 
456 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  62.86 
 
 
424 aa  497  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  45.82 
 
 
421 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  42.65 
 
 
445 aa  342  8e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  42.4 
 
 
445 aa  341  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  42.4 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  42.16 
 
 
445 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  42.16 
 
 
445 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  42.16 
 
 
445 aa  339  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  42.16 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
447 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
442 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  40.86 
 
 
445 aa  332  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 
444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  35.96 
 
 
438 aa  296  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  36.2 
 
 
435 aa  287  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  36.48 
 
 
441 aa  286  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  36.64 
 
 
443 aa  281  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  33.41 
 
 
461 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  31.43 
 
 
428 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  30.86 
 
 
439 aa  236  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  30.85 
 
 
374 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 
389 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.07 
 
 
384 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3805  coproporphyrinogen III oxidase  26.02 
 
 
445 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0536703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.63 
 
 
432 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.08 
 
 
412 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4862  coproporphyrinogen III oxidase  25.44 
 
 
445 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.29137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.92 
 
 
466 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.92 
 
 
381 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.27 
 
 
349 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.49 
 
 
380 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
405 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
405 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
405 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
405 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
405 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
405 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
405 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  27.43 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.94 
 
 
380 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.16 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  27.43 
 
 
379 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  27.12 
 
 
378 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  26.02 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  23.48 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  27.08 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  26.78 
 
 
378 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  26.78 
 
 
378 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
405 aa  96.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.04 
 
 
403 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  27.92 
 
 
409 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  27.59 
 
 
378 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  26.78 
 
 
379 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  26.78 
 
 
378 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  23.1 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.27 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  26.78 
 
 
379 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  27.92 
 
 
409 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  25.42 
 
 
374 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  25.42 
 
 
374 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  29 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  26.44 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0799  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.47 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.65 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  26.44 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.22 
 
 
380 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  21.95 
 
 
411 aa  94  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  26.86 
 
 
404 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  27.21 
 
 
404 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  27.21 
 
 
404 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.14 
 
 
360 aa  94  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  27.21 
 
 
404 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  22.63 
 
 
411 aa  93.2  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
419 aa  93.2  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.8 
 
 
383 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.69 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 
375 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  23.7 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.74 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  23.39 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  26.22 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  25.14 
 
 
377 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
377 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.45 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  26.5 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  27.72 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  25.66 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>