More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3801 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  92.79 
 
 
447 aa  872    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  99.55 
 
 
445 aa  927    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  91.91 
 
 
445 aa  872    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  96.63 
 
 
445 aa  906    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  89.89 
 
 
442 aa  847    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  97.08 
 
 
445 aa  910    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  98.2 
 
 
445 aa  919    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
445 aa  932    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
445 aa  932    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  84.04 
 
 
445 aa  806    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  96.85 
 
 
445 aa  908    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  96.63 
 
 
445 aa  906    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  99.78 
 
 
445 aa  929    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  91.24 
 
 
445 aa  862    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  83.14 
 
 
444 aa  776    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  41.89 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  43.8 
 
 
421 aa  339  5e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  42.16 
 
 
435 aa  339  5.9999999999999996e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 
443 aa  334  2e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  40.09 
 
 
441 aa  334  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  41.71 
 
 
438 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
448 aa  322  8e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  41.21 
 
 
454 aa  318  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  38.3 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  38.35 
 
 
454 aa  309  5e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  37.71 
 
 
424 aa  298  2e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  39.23 
 
 
439 aa  288  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  37.32 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.03 
 
 
375 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  27.42 
 
 
374 aa  133  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
379 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.81 
 
 
406 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.65 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  28.84 
 
 
379 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.48 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.91 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.99 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  26.91 
 
 
379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
378 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
378 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
378 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
379 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
378 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
379 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  28.38 
 
 
378 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  27.06 
 
 
378 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.4 
 
 
432 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.71 
 
 
368 aa  123  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.07 
 
 
389 aa  123  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  27.06 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  30.56 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  28.12 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1654  coproporphyrinogen III oxidase  28.77 
 
 
350 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.58488  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.9 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  30.47 
 
 
377 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.74 
 
 
381 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.94 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  27.07 
 
 
465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.49 
 
 
378 aa  117  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.03 
 
 
389 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  24.33 
 
 
431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  27 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.92 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0781  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.47 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.41975  normal  0.123732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.39 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.36 
 
 
385 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 
377 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.84 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  25.2 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  25.2 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  28.65 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  26.15 
 
 
379 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  26.88 
 
 
375 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  26.77 
 
 
403 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.05 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  24.13 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1240  coproporphyrinogen III oxidase  25.31 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000912695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.85 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.22 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3486  coproporphyrinogen III oxidase  25.81 
 
 
392 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.81 
 
 
388 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.72 
 
 
378 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.08 
 
 
376 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  27.84 
 
 
375 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  26.29 
 
 
393 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.86 
 
 
401 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
381 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.01 
 
 
416 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.62 
 
 
383 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.21 
 
 
357 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.92 
 
 
385 aa  107  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.33 
 
 
372 aa  106  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3473  coproporphyrinogen III oxidase  25.69 
 
 
392 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0588926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3536  coproporphyrinogen III oxidase  25.69 
 
 
392 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15747  normal  0.866519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.02 
 
 
385 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
510 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.5 
 
 
374 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>