More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  68.27 
 
 		 438 aa  648    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 461 aa  962    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  63.89 
 
 		 435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  55.9 
 
 		 441 aa  525  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  54.07 
 
 		 443 aa  495  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  40.44 
 
 		 444 aa  326  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  36.77 
 
 		 421 aa  312  6.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 447 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  37.94 
 
 		 445 aa  306  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  36.28 
 
 		 445 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  35.84 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  33.11 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  33.41 
 
 		 435 aa  281  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  33.02 
 
 		 443 aa  276  5e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  34.35 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  33.18 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  32.26 
 
 		 448 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  32.01 
 
 		 456 aa  256  4e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  29.85 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  31.71 
 
 		 439 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0241  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  34.62 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.49 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0263  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.62 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.46476  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.17 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  29.65 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1290  Coproporphyrinogen dehydrogenase  32.79 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.09 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.29 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 		 375 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  31.46 
 
 		 394 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.39 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.17 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.69 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.33 
 
 		 398 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.98 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31 
 
 		 403 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.25 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  33.49 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0252  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.17 
 
 		 379 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.89 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  23.54 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  22.92 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.51 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  23.74 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.03 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.51 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  23.13 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  32.99 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  24.6 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0997  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  31.63 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.16 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.2 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  32.49 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  26.36 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.96 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  26.54 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.31 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  30.53 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.11 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  31.16 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.83 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  31.16 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.06 
 
 		 372 aa  103  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.16 
 
 		 378 aa  103  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.26 
 
 		 389 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  30.09 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  30.09 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.02 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  23.13 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.58 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  30.09 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  33.01 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  30.7 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  30.09 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.56 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.58 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0799  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.82 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.39 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  30.23 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  30.73 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  25.96 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  31.22 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  30.23 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  30.23 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  30.13 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1118  coproporphyrinogen III oxidase  30.48 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.76 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  25.46 
 
 		 494 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>