More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4126 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  90.34 
 
 
445 aa  848    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  89.21 
 
 
445 aa  840    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  90.11 
 
 
445 aa  848    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  92.38 
 
 
447 aa  851    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  89.44 
 
 
445 aa  842    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  89.21 
 
 
445 aa  840    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  91.01 
 
 
445 aa  854    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
442 aa  924    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  89.89 
 
 
445 aa  847    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  89.89 
 
 
445 aa  847    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  83.37 
 
 
445 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  89.89 
 
 
445 aa  847    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  80.27 
 
 
444 aa  755    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  89.44 
 
 
445 aa  841    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  90.34 
 
 
445 aa  844    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  42.62 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
435 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  43.51 
 
 
421 aa  334  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  42.74 
 
 
443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  41.5 
 
 
438 aa  326  6e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  38.77 
 
 
441 aa  324  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  42.82 
 
 
448 aa  319  6e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  42.82 
 
 
456 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 
454 aa  310  4e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  37.18 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  39.21 
 
 
454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  39.95 
 
 
439 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
424 aa  292  1e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  36.74 
 
 
428 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
379 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  28.12 
 
 
379 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.77 
 
 
380 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.47 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.65 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  26.91 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
379 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
379 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  26.58 
 
 
374 aa  126  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  27.06 
 
 
379 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  27.06 
 
 
378 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.44 
 
 
406 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.28 
 
 
387 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.07 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.95 
 
 
360 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  28.25 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.78 
 
 
389 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.17 
 
 
380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.48 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.72 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.25 
 
 
385 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.81 
 
 
411 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  28.42 
 
 
382 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.19 
 
 
381 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  25.61 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  25.61 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1654  coproporphyrinogen III oxidase  29.14 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.58488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  26.08 
 
 
379 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.16 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  26.78 
 
 
465 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  26.95 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  27.38 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  24.63 
 
 
431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.85 
 
 
357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.86 
 
 
378 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.45 
 
 
377 aa  110  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.76 
 
 
378 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0781  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.66 
 
 
400 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.41975  normal  0.123732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.87 
 
 
422 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1240  coproporphyrinogen III oxidase  25.45 
 
 
404 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000912695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2770  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.03 
 
 
391 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.88 
 
 
381 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  27.81 
 
 
379 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.13 
 
 
389 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.88 
 
 
462 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  23.54 
 
 
398 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.08 
 
 
378 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  26.56 
 
 
403 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.46 
 
 
403 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.32 
 
 
376 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3486  coproporphyrinogen III oxidase  27.18 
 
 
392 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.16 
 
 
416 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  27.4 
 
 
375 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.77 
 
 
380 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
387 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  24.58 
 
 
394 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.18 
 
 
385 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.01 
 
 
388 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3473  coproporphyrinogen III oxidase  26.95 
 
 
392 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0588926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3536  coproporphyrinogen III oxidase  26.95 
 
 
392 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15747  normal  0.866519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.65 
 
 
401 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.24 
 
 
383 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1636  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.87 
 
 
406 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.234243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  24.36 
 
 
375 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>