More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1654 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1654  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
350 aa  717    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.58488  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1379  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  55.71 
 
 
351 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000560145  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1573  coproporphyrinogen III oxidase  49.14 
 
 
348 aa  340  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0997  coproporphyrinogen III oxidase  52.44 
 
 
344 aa  334  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125756  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1118  coproporphyrinogen III oxidase  48.57 
 
 
346 aa  334  2e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123325  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0608  coproporphyrinogen III oxidase  45.63 
 
 
355 aa  305  6e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0683  coproporphyrinogen III oxidase  45.63 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1089  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 
355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0667  coproporphyrinogen III oxidase  47.71 
 
 
349 aa  298  1e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.38 
 
 
380 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 
368 aa  196  6e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.23 
 
 
349 aa  194  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35 
 
 
393 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 
379 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 
378 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  36.06 
 
 
379 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 
379 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 
379 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 
378 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 
379 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.94 
 
 
382 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  35.91 
 
 
378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.34 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  34.44 
 
 
385 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.44 
 
 
385 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3668  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.65 
 
 
388 aa  188  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.231493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 
382 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.28 
 
 
385 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.44 
 
 
387 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.54 
 
 
378 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 
378 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  36.68 
 
 
374 aa  186  7e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.75 
 
 
406 aa  186  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 
391 aa  185  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.04 
 
 
578 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  33.52 
 
 
378 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.65 
 
 
385 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.69 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.42 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  35.29 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  34.35 
 
 
393 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  34.81 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  36.31 
 
 
375 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.31 
 
 
375 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  32.72 
 
 
379 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  29.67 
 
 
394 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.94 
 
 
393 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.67 
 
 
376 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  32.58 
 
 
386 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  35.45 
 
 
378 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.94 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  35.05 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.62 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  35.69 
 
 
375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2303  hypothetical protein  40.75 
 
 
375 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2276  hypothetical protein  40.75 
 
 
375 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.63 
 
 
375 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07700  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.61 
 
 
368 aa  179  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  33.62 
 
 
387 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 
377 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  28.73 
 
 
398 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0165  coproporphyrinogen oxidase (coproporphyrinogen III oxidase)  36.02 
 
 
373 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.763893  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  29.46 
 
 
409 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  35.98 
 
 
376 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.47 
 
 
383 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.34 
 
 
422 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.37 
 
 
423 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  32.96 
 
 
386 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  37.94 
 
 
386 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  34.97 
 
 
384 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  37.46 
 
 
385 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  36.04 
 
 
383 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2866  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 
379 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00010545  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.77 
 
 
378 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.11 
 
 
380 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.482476  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.26 
 
 
384 aa  175  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  32.58 
 
 
385 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  32.58 
 
 
390 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  36.89 
 
 
377 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.94 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  35.94 
 
 
383 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  34.15 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  34.15 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.66 
 
 
484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1376  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.17 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  36.73 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.61 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  32.31 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  35.56 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 
408 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  35.38 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.76 
 
 
403 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.81 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  34.17 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  32.53 
 
 
388 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0124  coproporphyrinogen III oxidase  38.2 
 
 
392 aa  172  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2693  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.66 
 
 
387 aa  173  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  34.87 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  31.3 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>