More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1710 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 
441 aa  916    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  76.43 
 
 
443 aa  697    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  67.81 
 
 
438 aa  626  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  58.9 
 
 
435 aa  528  1e-148  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  55.9 
 
 
461 aa  525  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  42.28 
 
 
444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  40.19 
 
 
445 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  40.19 
 
 
445 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  40.19 
 
 
445 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  40.19 
 
 
445 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 
447 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  40.19 
 
 
445 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  38.77 
 
 
442 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  35 
 
 
421 aa  292  9e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  36.48 
 
 
435 aa  286  7e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 
443 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  33.1 
 
 
424 aa  278  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  35.86 
 
 
454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  36.27 
 
 
454 aa  266  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  34.7 
 
 
448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  34.87 
 
 
456 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  30.44 
 
 
439 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  27.4 
 
 
428 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.41 
 
 
376 aa  119  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  25.33 
 
 
378 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  26.27 
 
 
378 aa  114  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.53 
 
 
380 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.22 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.45 
 
 
378 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  25.19 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  27.16 
 
 
379 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  28.8 
 
 
394 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  26.48 
 
 
374 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.07 
 
 
375 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  34.3 
 
 
376 aa  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.53 
 
 
388 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  25.13 
 
 
379 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.03 
 
 
389 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.58 
 
 
432 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  25.14 
 
 
377 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 
384 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  24.09 
 
 
377 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.59 
 
 
422 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  24.55 
 
 
378 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  24.81 
 
 
378 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  26.89 
 
 
460 aa  103  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  24.81 
 
 
379 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  24.81 
 
 
379 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  24.28 
 
 
379 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  24.81 
 
 
378 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 
484 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.23 
 
 
378 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.94 
 
 
457 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  25.81 
 
 
376 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  25.97 
 
 
382 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  23.58 
 
 
379 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  24.61 
 
 
378 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.01 
 
 
380 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  26.15 
 
 
374 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  26.15 
 
 
374 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  26 
 
 
443 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  25.37 
 
 
452 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.67 
 
 
372 aa  99  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  23.96 
 
 
463 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  25.31 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.64 
 
 
393 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.19 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.67 
 
 
372 aa  98.2  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.94 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.85 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.67 
 
 
388 aa  97.4  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  26.48 
 
 
408 aa  97.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.17 
 
 
382 aa  96.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.37 
 
 
461 aa  96.7  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.02 
 
 
385 aa  96.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.02 
 
 
385 aa  96.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  25.43 
 
 
408 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2770  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.18 
 
 
391 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.81 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  25.06 
 
 
379 aa  96.3  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  24.68 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  26.42 
 
 
450 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0997  coproporphyrinogen III oxidase  28.7 
 
 
344 aa  95.5  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125756  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3165  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.19 
 
 
401 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.99 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.95 
 
 
387 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.91 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.81 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  24.86 
 
 
446 aa  94.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.53 
 
 
365 aa  94.4  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  23.96 
 
 
463 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.81 
 
 
398 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  23.92 
 
 
446 aa  94.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>