More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0275 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 		 421 aa  866    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  43.9 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  48.4 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  45.82 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  47.41 
 
 		 456 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  47.41 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  46.56 
 
 		 454 aa  353  5e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  44.05 
 
 		 445 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  43.8 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  43.8 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  43.8 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  43.29 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  43.29 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  43.04 
 
 		 445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  43.04 
 
 		 445 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  43.04 
 
 		 445 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  43.04 
 
 		 445 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  43.04 
 
 		 445 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  43.51 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  42.68 
 
 		 445 aa  333  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 		 444 aa  332  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  39.28 
 
 		 438 aa  331  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  42.53 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 461 aa  312  5.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  35 
 
 		 441 aa  292  9e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  35.47 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  35.31 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  35.75 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  29.81 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.59 
 
 		 372 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.66 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.36 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  27.79 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  27.97 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  28.14 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  26.9 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  27.23 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  27.97 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.25 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  27.23 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  27.23 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  27.35 
 
 		 378 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  27.35 
 
 		 379 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  27.7 
 
 		 379 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  26.96 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.89 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  26.92 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.06 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  25.97 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  25.97 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  26.61 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.1 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  25.7 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.28 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  25.64 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.08 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.54 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.5 
 
 		 378 aa  99  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  28.19 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.53 
 
 		 388 aa  98.2  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.19 
 
 		 412 aa  96.7  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  25.93 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0241  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.96 
 
 		 379 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.68 
 
 		 380 aa  96.3  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.34 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  23.84 
 
 		 409 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.26 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.650734  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0997  coproporphyrinogen III oxidase  29.5 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  27.38 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0263  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.47 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.46476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  23.62 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.82 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  32.29 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.8 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  24.21 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  34.55 
 
 		 476 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.38 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.86 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  26.16 
 
 		 463 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1180  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.12 
 
 		 401 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219055  hitchhiker  0.00393596 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1170  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.6 
 
 		 369 aa  94  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  24.26 
 
 		 470 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  26.65 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.06 
 
 		 578 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1841  coproporphyrinogen III oxidase  25.54 
 
 		 439 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  25.12 
 
 		 463 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  24.01 
 
 		 460 aa  93.2  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  25.56 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1104  coproporphyrinogen III oxidase  25.67 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.65 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  29.05 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  22.58 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.59 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>