More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0047 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 424 aa  859    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  62.86 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  58.05 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  55 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  53.72 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  56.83 
 
 		 456 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  56.59 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  43.9 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  36.92 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  37.71 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  37.71 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  37.71 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  37.71 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  37.71 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  37.41 
 
 		 445 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  33.11 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  36.98 
 
 		 447 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 442 aa  292  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  36.74 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  36.41 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  33.1 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  33.72 
 
 		 443 aa  276  6e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  32.16 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  29.7 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.52 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  27.86 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.61 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.63 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 443 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.72 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  25.75 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0384  coproporphyrinogen III oxidase  24.57 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  28.17 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  25.2 
 
 		 378 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  26.76 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.68 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  26.86 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  29.48 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  26.86 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  26.86 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  27.34 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  29.48 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.76 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  26.86 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  26.5 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  25.14 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  25.14 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  29.79 
 
 		 382 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.46 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  26.6 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  29.63 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  29.63 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  29.63 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3805  coproporphyrinogen III oxidase  26.82 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0536703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  30.04 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  25.6 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.37 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  29.89 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.41 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4862  coproporphyrinogen III oxidase  26.49 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.29137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.75 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.35 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.84 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.37 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.75 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  26.48 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  24.66 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  25.07 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  30.11 
 
 		 404 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  26.76 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.45 
 
 		 384 aa  100  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.92 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  28.73 
 
 		 409 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  29.3 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  23.04 
 
 		 494 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  25.72 
 
 		 376 aa  99  2e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  30.74 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  23.97 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1379  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.72 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000560145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0241  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.96 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  23.81 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  22.77 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  32.68 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  23.68 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0263  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.96 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.46476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1583  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.62 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 		 385 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  27.44 
 
 		 409 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  27.86 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  32.12 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>