More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0076 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  84.94 
 
 		 445 aa  805    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  84.49 
 
 		 445 aa  803    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  84.27 
 
 		 445 aa  801    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  84.04 
 
 		 445 aa  806    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  84.72 
 
 		 445 aa  805    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  83.82 
 
 		 445 aa  803    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  84.04 
 
 		 445 aa  806    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  84.04 
 
 		 445 aa  806    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  84.94 
 
 		 445 aa  803    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 445 aa  930    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  84.04 
 
 		 445 aa  807    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  83.37 
 
 		 442 aa  791    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  80.42 
 
 		 444 aa  751    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  85.36 
 
 		 447 aa  802    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  84.72 
 
 		 445 aa  805    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  43.1 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  42.68 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  42.2 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  40.86 
 
 		 435 aa  332  8e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  40.19 
 
 		 441 aa  330  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  39.66 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  41.06 
 
 		 456 aa  325  7e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  41.06 
 
 		 448 aa  325  7e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  37.88 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 		 454 aa  302  9e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  35.84 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  37.41 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  40.1 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  37.11 
 
 		 428 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  28.15 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.87 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.9 
 
 		 375 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.67 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  28.12 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  27.25 
 
 		 379 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  28.61 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.81 
 
 		 380 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  27.32 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  28.38 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  27.32 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  27.32 
 
 		 378 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  27.32 
 
 		 378 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  27.32 
 
 		 378 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  27.32 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  27.06 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.49 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.97 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  26.02 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  26.02 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.25 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  30.8 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  26.19 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  25.98 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  27.32 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.01 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.29 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.36 
 
 		 389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.37 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.08 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1654  coproporphyrinogen III oxidase  29.14 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.58488  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  28.65 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.63 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.87 
 
 		 387 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3486  coproporphyrinogen III oxidase  28.66 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.37 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3473  coproporphyrinogen III oxidase  28.48 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0588926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.25 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3536  coproporphyrinogen III oxidase  28.48 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15747  normal  0.866519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  24.09 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  26.88 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  25.32 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  26.72 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  28.7 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.13 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1240  coproporphyrinogen III oxidase  24.94 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000912695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.25 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.29 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1583  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.6 
 
 		 374 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.31 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  28.91 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.48 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.59 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  25.91 
 
 		 403 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0781  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.01 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.41975  normal  0.123732 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  27 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.56 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1224  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.08 
 
 		 370 aa  104  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.948437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.46 
 
 		 372 aa  104  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0222  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 		 371 aa  104  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.55 
 
 		 372 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.88 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  23.87 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.45 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  26.51 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  26.36 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.87 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.32 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.94 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>