More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1563 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0386  coproporphyrinogen III oxidase  80.32 
 
 
448 aa  719    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0412  coproporphyrinogen III oxidase  80.09 
 
 
456 aa  714    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0809182  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1563  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
443 aa  899    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1538  coproporphyrinogen III oxidase  59.63 
 
 
454 aa  547  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1654  coproporphyrinogen III oxidase  58.72 
 
 
454 aa  536  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1666  coproporphyrinogen III oxidase  61.68 
 
 
435 aa  537  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0047  coproporphyrinogen III oxidase  58.05 
 
 
424 aa  473  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0275  Coproporphyrinogen dehydrogenase  48.4 
 
 
421 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0557282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3506  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 
445 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4118  coproporphyrinogen III oxidase  40.38 
 
 
445 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0219  coproporphyrinogen III oxidase  40.38 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0221  coproporphyrinogen III oxidase  40.38 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0517942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3730  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.421344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3801  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3926  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4239  coproporphyrinogen III oxidase  40.38 
 
 
445 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4520  coproporphyrinogen III oxidase  40.62 
 
 
445 aa  333  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4806  coproporphyrinogen III oxidase  40.62 
 
 
445 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0073  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 
447 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0076  coproporphyrinogen III oxidase  39.66 
 
 
445 aa  330  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4126  coproporphyrinogen III oxidase  42.74 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4414  coproporphyrinogen III oxidase  39.9 
 
 
445 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3604  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 
444 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0037  Coproporphyrinogen dehydrogenase  36.1 
 
 
438 aa  294  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1710  Coproporphyrinogen dehydrogenase  36.32 
 
 
441 aa  283  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00440  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  35.48 
 
 
443 aa  279  7e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27820  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  33.02 
 
 
461 aa  276  5e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11490  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 
435 aa  271  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.297605  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3397  coproporphyrinogen dehydrogenase  34.9 
 
 
439 aa  255  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2394  coproporphyrinogen dehydrogenase  34.51 
 
 
428 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.93 
 
 
384 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  30.48 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.51 
 
 
381 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.1 
 
 
360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  29.67 
 
 
378 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  29.67 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  30.64 
 
 
379 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  29.67 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  27.47 
 
 
377 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  30.3 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  27.47 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  30.3 
 
 
378 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  30.57 
 
 
378 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  29.17 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  29.95 
 
 
376 aa  114  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 
379 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.04 
 
 
380 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  29.67 
 
 
379 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  30.93 
 
 
382 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 
378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 
443 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  29.78 
 
 
375 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.25 
 
 
380 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.18 
 
 
375 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.16 
 
 
432 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.23 
 
 
368 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.14 
 
 
382 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.1 
 
 
389 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.05 
 
 
371 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0944  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.93 
 
 
375 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.16 
 
 
371 aa  107  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.88 
 
 
376 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.38 
 
 
377 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.54 
 
 
388 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.83 
 
 
374 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2375  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.1 
 
 
374 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.950801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.43 
 
 
578 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  25.82 
 
 
374 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  25.82 
 
 
374 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.62 
 
 
378 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0222  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.2 
 
 
371 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  25.48 
 
 
379 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.93 
 
 
381 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.66 
 
 
387 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1379  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.71 
 
 
351 aa  103  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000560145  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.44 
 
 
372 aa  103  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.78 
 
 
382 aa  103  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.84 
 
 
378 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0241  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25 
 
 
379 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  25.99 
 
 
379 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  29.75 
 
 
393 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  21.96 
 
 
414 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.86 
 
 
380 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.650734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.42 
 
 
383 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  29.15 
 
 
399 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.87 
 
 
448 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1716  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.68 
 
 
384 aa  99.8  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.871197  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4085  Coproporphyrinogen dehydrogenase  28.24 
 
 
468 aa  99  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.97 
 
 
357 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  24.73 
 
 
386 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  30.91 
 
 
375 aa  99  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.97 
 
 
378 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  30.58 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.89 
 
 
385 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4222  coproporphyrinogen III oxidase  26.09 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.98 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.26 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>