More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0070 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
232 aa  470  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  99.14 
 
 
232 aa  468  1e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  99.14 
 
 
232 aa  468  1e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  2.68324e-07 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  99.14 
 
 
232 aa  468  1e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00067  hypothetical protein  98.71 
 
 
232 aa  465  1e-130  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  98.28 
 
 
232 aa  464  1e-130  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  98.71 
 
 
232 aa  465  1e-130  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  97.84 
 
 
232 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  97.41 
 
 
232 aa  457  1e-128  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  86.96 
 
 
235 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.051764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0117  thiamine transporter ATP-binding subunit  86.09 
 
 
235 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0112  thiamine transporter ATP-binding subunit  86.09 
 
 
235 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0113  thiamine transporter ATP-binding subunit  86.09 
 
 
235 aa  405  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.42965 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0110  thiamine transporter ATP-binding subunit  85.65 
 
 
235 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0613  thiamine transporter ATP-binding subunit  79.13 
 
 
235 aa  377  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0735  thiamine transporter ATP-binding subunit  64.94 
 
 
234 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3621  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.77 
 
 
236 aa  308  6e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.802335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3810  thiamine transporter ATP-binding subunit  61.47 
 
 
234 aa  305  5e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3544  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.48 
 
 
236 aa  304  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3416  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.48 
 
 
236 aa  304  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2945  thiamine transporter ATP-binding subunit  63.04 
 
 
236 aa  302  3e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.525623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0582  thiamine transporter ATP-binding subunit  62.17 
 
 
230 aa  293  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0621  thiamine transporter ATP-binding subunit  61.47 
 
 
237 aa  291  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0351  thiamine transport ATP-binding protein ThiQ  51.14 
 
 
224 aa  242  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001684  thiamin ABC transporter ATPase component  53.85 
 
 
234 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00790  hypothetical protein  51.1 
 
 
234 aa  232  4e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0387  ABC transporter for thiamin ATP-binding protein  50.72 
 
 
236 aa  228  9e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.040787  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1011  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.66 
 
 
214 aa  226  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.88 
 
 
238 aa  226  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1759  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.78 
 
 
241 aa  224  8e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00111297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1698  thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 
241 aa  224  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  52.91 
 
 
246 aa  218  8e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0328  ABC transporter related  43.69 
 
 
229 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1140  ABC transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 
258 aa  196  4e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.083935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3109  ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 
235 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2816  ABC transporter related  45.09 
 
 
231 aa  184  1e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.792279  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4268  thiamine ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
249 aa  182  5e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0060  ABC transporter related  48.79 
 
 
231 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1393  ABC thiamine transporter, ATPase subunit  48.31 
 
 
231 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  45.81 
 
 
347 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  42.72 
 
 
357 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2800  ABC transporter related  51.65 
 
 
231 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.43358  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2551  ABC transporter related  43.3 
 
 
347 aa  166  3e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  3.25534e-06 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44 
 
 
357 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1198  ABC transporter related  46.15 
 
 
204 aa  165  7e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  41.4 
 
 
316 aa  164  1e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 
368 aa  164  1e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 
370 aa  164  1e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  163  2e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 
378 aa  162  4e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  43.81 
 
 
360 aa  162  4e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  162  5e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  162  5e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  162  5e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  162  5e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.64 
 
 
378 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  43.35 
 
 
361 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  39.64 
 
 
368 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.95 
 
 
378 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  44.19 
 
 
308 aa  160  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.37 
 
 
390 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 
378 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3008  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.93 
 
 
378 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  42.23 
 
 
355 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  41.78 
 
 
357 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  42.86 
 
 
360 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.09 
 
 
377 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  42.86 
 
 
360 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  42.92 
 
 
359 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  42.86 
 
 
360 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1055  ABC transporter related  40.95 
 
 
366 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  42.86 
 
 
360 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
378 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.33 
 
 
372 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  42.38 
 
 
363 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  41.38 
 
 
305 aa  158  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.75 
 
 
372 aa  158  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2803  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.68 
 
 
362 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0416971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 
377 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
377 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.84 
 
 
360 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.84 
 
 
360 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.13 
 
 
384 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.43 
 
 
363 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  45.5 
 
 
371 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 
377 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4565  ABC transporter related  42.06 
 
 
361 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  41.79 
 
 
359 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
341 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.23 
 
 
378 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  38.89 
 
 
349 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 
377 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  42.38 
 
 
363 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 
377 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 
377 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 
377 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  43.75 
 
 
353 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.59 
 
 
352 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>