87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2593 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.12424e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.58279e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  6.26304e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  2.89722e-07  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  5.83084e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.27212e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  88.33 
 
 
184 aa  331  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  5.62976e-09  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  92.78 
 
 
184 aa  324  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  2.06294e-05  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  92.78 
 
 
184 aa  324  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  3.45832e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  92.78 
 
 
184 aa  324  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  5.30906e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  92.78 
 
 
184 aa  324  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  92.78 
 
 
184 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  3.32741e-06  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  83.83 
 
 
185 aa  295  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.4442e-11  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  82.08 
 
 
201 aa  280  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  6.30284e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  81.29 
 
 
216 aa  279  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  3.81919e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  81.29 
 
 
216 aa  279  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.98062e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  82.25 
 
 
203 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.23288e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  81.55 
 
 
182 aa  270  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.16771e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  81.55 
 
 
182 aa  270  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.33987e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  81.55 
 
 
182 aa  270  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.74563e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  40.61 
 
 
178 aa  126  1e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
181 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 
185 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  40 
 
 
178 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  40 
 
 
177 aa  120  1e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  38.1 
 
 
180 aa  120  1e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
178 aa  110  8e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
178 aa  110  1e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
185 aa  107  9e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
177 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
177 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
178 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
178 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  32.75 
 
 
459 aa  94  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  34.78 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
169 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
181 aa  89  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.09349e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
183 aa  82.8  3e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
187 aa  76.3  2e-13  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
178 aa  70.1  2e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  31.65 
 
 
170 aa  66.2  2e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
182 aa  63.5  2e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.5 
 
 
184 aa  56.2  2e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.15 
 
 
199 aa  55.8  3e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  30.57 
 
 
196 aa  55.8  3e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.86 
 
 
199 aa  55.8  3e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
182 aa  54.3  9e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 
189 aa  53.5  1e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  26.22 
 
 
178 aa  53.5  2e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  31.74 
 
 
238 aa  48.1  6e-05  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  27.7 
 
 
161 aa  48.1  6e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
277 aa  48.1  7e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  29.83 
 
 
277 aa  48.1  7e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.38 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.21 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
283 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.92 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  4.97991e-06 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
182 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  29.75 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  23.84 
 
 
331 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  32.94 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18064e-05 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 
322 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.73 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.59 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 
273 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1831  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.90359e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.12 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
273 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  30.56 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.59 
 
 
177 aa  42  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
240 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
173 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.63849e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  29.67 
 
 
203 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  47.17 
 
 
314 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  25.69 
 
 
451 aa  41.2  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5046  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  25 
 
 
174 aa  41.2  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.44 
 
 
174 aa  41.2  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.1 
 
 
213 aa  40.8  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>