79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5046 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5046  NUDIX hydrolase  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5364  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2410  MutT/Nudix family protein  40.43 
 
 
158 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.781374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0161  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  48.21 
 
 
190 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  30.99 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
171 aa  48.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1287  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
196 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  29.29 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
231 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
189 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  47.06 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  39.68 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
216 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  29.29 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  37.4 
 
 
213 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  29.29 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  29.29 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  38.46 
 
 
204 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  39.71 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  42.31 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  35 
 
 
199 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
243 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
242 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
197 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
244 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
222 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88634  predicted protein  37.21 
 
 
360 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.66432  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  42.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
211 aa  42.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  30 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
225 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
227 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  42.59 
 
 
237 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
165 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
191 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
226 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
300 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
254 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 
225 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
301 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  33.91 
 
 
314 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
235 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  33.59 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
227 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0623  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
213 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
202 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
219 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
195 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
213 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  46.3 
 
 
269 aa  40  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  37.21 
 
 
238 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
235 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
208 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
239 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>