More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0824 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 
880 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  59.78 
 
 
820 aa  1004    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 
896 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 
910 aa  708    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 
910 aa  710    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 
876 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  90.17 
 
 
804 aa  1499    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  43.76 
 
 
888 aa  685    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  43.5 
 
 
875 aa  684    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 
878 aa  706    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 
916 aa  648    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  43.53 
 
 
908 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  45.11 
 
 
929 aa  712    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 
898 aa  707    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  44.42 
 
 
911 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  44.38 
 
 
915 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  44.47 
 
 
815 aa  680    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
804 aa  1655    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  42.8 
 
 
877 aa  661    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
882 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  42.57 
 
 
925 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  43.93 
 
 
907 aa  701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  43.24 
 
 
883 aa  684    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 
923 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 
907 aa  712    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  44.33 
 
 
879 aa  708    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  44.27 
 
 
910 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  43.85 
 
 
881 aa  689    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 
916 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  43.96 
 
 
908 aa  704    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 
877 aa  676    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 
921 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  43.5 
 
 
880 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 
914 aa  691    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
905 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 
897 aa  623  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 
929 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 
904 aa  621  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 
919 aa  616  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 
962 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 
904 aa  613  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 
872 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 
858 aa  611  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 
891 aa  604  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.68 
 
 
873 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 
889 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 
871 aa  601  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
872 aa  598  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 
863 aa  601  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 
896 aa  599  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 
870 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 
864 aa  595  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 
869 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 
932 aa  593  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  39.31 
 
 
870 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 
881 aa  592  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 
868 aa  587  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 
828 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.17 
 
 
856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 
870 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  38.9 
 
 
904 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 
853 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.66 
 
 
859 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 
863 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  39.34 
 
 
896 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 
869 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  38.65 
 
 
867 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  38.51 
 
 
854 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 
872 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  38.94 
 
 
882 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 
857 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 
873 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  38.24 
 
 
882 aa  572  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  38.41 
 
 
878 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 
897 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 
881 aa  566  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 
898 aa  567  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 
862 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  38.21 
 
 
855 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 
868 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  38.33 
 
 
863 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  39.09 
 
 
872 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  38.79 
 
 
863 aa  561  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  38.09 
 
 
855 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  38.21 
 
 
855 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  38.21 
 
 
855 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  38.5 
 
 
869 aa  559  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 
900 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  38.34 
 
 
863 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  38.3 
 
 
895 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  37.58 
 
 
855 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  38.21 
 
 
855 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  38.66 
 
 
905 aa  562  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.54 
 
 
887 aa  560  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  37.59 
 
 
858 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  38.91 
 
 
819 aa  559  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 
875 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 
910 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  38.56 
 
 
872 aa  558  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  37.78 
 
 
855 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>