204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1403 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1403  Rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
268 aa  542  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000400857  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
286 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 
274 aa  92  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  26.28 
 
 
317 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  26.29 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  25.09 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  24.75 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  35.16 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  23.57 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  23.74 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  24.48 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  26.49 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  24.47 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  23.94 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  24.48 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  26.22 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  23.08 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  23.47 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  23.47 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  23.18 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  25.33 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  24.22 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  23.08 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  23.58 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  25.13 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  27.53 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 
359 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  24.21 
 
 
317 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  25.33 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  22.76 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  25.98 
 
 
359 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  25.98 
 
 
357 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  22.27 
 
 
357 aa  62.4  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  22.86 
 
 
330 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  23.81 
 
 
283 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  25.2 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  24.59 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
348 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  21.4 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 
325 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  24.31 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  24.07 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  27.36 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  24.76 
 
 
311 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  24.07 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  22.22 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  20.82 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  27.86 
 
 
283 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 
304 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
332 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
330 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  24.5 
 
 
346 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 
283 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 
283 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
333 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  24.07 
 
 
324 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  25.13 
 
 
272 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  22.42 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 
362 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  22.37 
 
 
299 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  27.09 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  27.36 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  24.09 
 
 
414 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  22.37 
 
 
296 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  23.98 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  27.98 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  25.13 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  23.56 
 
 
306 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  23.49 
 
 
272 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  28.5 
 
 
257 aa  55.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  23.25 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  23.29 
 
 
336 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>