More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0186 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
477 aa  978    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.62 
 
 
488 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.64 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.75 
 
 
478 aa  425  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.75 
 
 
478 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.79 
 
 
495 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.01 
 
 
529 aa  309  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.9 
 
 
552 aa  305  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.57 
 
 
528 aa  303  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  37.74 
 
 
505 aa  299  8e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.02 
 
 
484 aa  299  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.64 
 
 
546 aa  296  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.19 
 
 
504 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.56 
 
 
505 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  35.48 
 
 
489 aa  289  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.32 
 
 
478 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.46 
 
 
505 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  36.16 
 
 
542 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.46 
 
 
505 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.46 
 
 
505 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  35.64 
 
 
499 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.67 
 
 
504 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.39 
 
 
498 aa  285  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.36 
 
 
504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.26 
 
 
507 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.38 
 
 
480 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  36.09 
 
 
512 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.71 
 
 
547 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.12 
 
 
543 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.15 
 
 
503 aa  279  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  35.44 
 
 
488 aa  279  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.42 
 
 
478 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.67 
 
 
480 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.81 
 
 
523 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.12 
 
 
480 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.78 
 
 
522 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.96 
 
 
479 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.96 
 
 
479 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  34.39 
 
 
513 aa  269  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.11 
 
 
480 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.55 
 
 
544 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.36 
 
 
514 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  34.06 
 
 
480 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  35.82 
 
 
477 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.23 
 
 
503 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  35.24 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.91 
 
 
483 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.13 
 
 
517 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.91 
 
 
480 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.05 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  38.12 
 
 
430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  37.72 
 
 
477 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  37.72 
 
 
477 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  37.72 
 
 
477 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  37.72 
 
 
477 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  37.72 
 
 
477 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  37.72 
 
 
477 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  37.72 
 
 
477 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  35.85 
 
 
478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.57 
 
 
478 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  32.63 
 
 
481 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.08 
 
 
475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 
454 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 
458 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.5 
 
 
473 aa  196  7e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 
458 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.58 
 
 
458 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.74 
 
 
481 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.61 
 
 
458 aa  186  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.02 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.03 
 
 
474 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.94 
 
 
457 aa  177  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.8 
 
 
443 aa  176  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.45 
 
 
458 aa  170  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.52 
 
 
458 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 
461 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.61 
 
 
454 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  30.8 
 
 
445 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.66 
 
 
458 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  28.15 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.39 
 
 
459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.72 
 
 
462 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.78 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  25.73 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.66 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.37 
 
 
459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  28.93 
 
 
464 aa  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.14 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.58 
 
 
485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.56 
 
 
470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.84 
 
 
460 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.11 
 
 
471 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  27.47 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  27.68 
 
 
466 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 
483 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  27.25 
 
 
470 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 
456 aa  139  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.59 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.59 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>