267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4154 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  634    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 		 309 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  46.42 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  46.74 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  46.39 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  45.02 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  44.25 
 
 		 342 aa  245  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  45.26 
 
 		 597 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  43.93 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  41.43 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  38.41 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  38.11 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  38.11 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  37.54 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  34.36 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.65 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  29.27 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  33.43 
 
 		 327 aa  99.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  34.13 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  32.36 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  30.67 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.74 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.64 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  31.91 
 
 		 349 aa  92.4  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  25.86 
 
 		 323 aa  92.4  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  26.79 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.7 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.93 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.82 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  27.82 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  28.81 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  27.08 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.69 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  28.28 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  25.84 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  26.09 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  29.82 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  27 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  24.36 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 595 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  25.27 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  26.79 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  36 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  22.12 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  31.02 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>