More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1887 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  44.71 
 
 		 888 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  46.21 
 
 		 837 aa  763    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 		 875 aa  664    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  44.51 
 
 		 858 aa  719    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  49.43 
 
 		 871 aa  815    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 		 878 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 856 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.8 
 
 		 854 aa  672    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  44.98 
 
 		 873 aa  785    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  42.61 
 
 		 854 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 863 aa  641    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  44.02 
 
 		 881 aa  753    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  46.02 
 
 		 892 aa  793    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 872 aa  664    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 		 858 aa  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  46.78 
 
 		 890 aa  805    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  50.88 
 
 		 897 aa  887    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  54 
 
 		 932 aa  899    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  45.91 
 
 		 892 aa  795    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  46.12 
 
 		 890 aa  796    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  46.14 
 
 		 894 aa  796    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  46.23 
 
 		 890 aa  798    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  41.35 
 
 		 856 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  44.47 
 
 		 882 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  47.38 
 
 		 860 aa  835    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  46.02 
 
 		 882 aa  700    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 		 872 aa  758    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 		 823 aa  661    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 		 872 aa  758    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 		 900 aa  768    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 		 856 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 868 aa  1786    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  45.44 
 
 		 854 aa  708    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 856 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 		 865 aa  655    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  47.33 
 
 		 869 aa  830    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  51.72 
 
 		 882 aa  841    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  48.74 
 
 		 870 aa  837    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  47.94 
 
 		 872 aa  796    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  45.62 
 
 		 882 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 		 873 aa  659    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  46.75 
 
 		 895 aa  823    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  49.37 
 
 		 872 aa  826    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 904 aa  661    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 		 871 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  45.91 
 
 		 892 aa  795    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  45.19 
 
 		 872 aa  713    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 		 882 aa  693    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  45.21 
 
 		 853 aa  769    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  44.01 
 
 		 907 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  50.35 
 
 		 863 aa  820    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 		 872 aa  665    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  46.47 
 
 		 882 aa  705    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  51.76 
 
 		 870 aa  930    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 		 892 aa  692    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.04 
 
 		 854 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  49.02 
 
 		 867 aa  862    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  41.31 
 
 		 896 aa  647    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  41.35 
 
 		 856 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 887 aa  641    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  40.71 
 
 		 928 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 		 881 aa  727    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  44.59 
 
 		 888 aa  688    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  51.38 
 
 		 873 aa  912    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  48.04 
 
 		 850 aa  768    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  48.51 
 
 		 869 aa  819    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  46 
 
 		 887 aa  807    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  50.22 
 
 		 896 aa  877    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  45.91 
 
 		 892 aa  795    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 855 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44.33 
 
 		 858 aa  702    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 		 903 aa  654    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 		 882 aa  727    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  43.19 
 
 		 872 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  42.4 
 
 		 874 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  47.63 
 
 		 863 aa  830    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  48.67 
 
 		 870 aa  815    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  46.35 
 
 		 872 aa  783    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  45.8 
 
 		 892 aa  795    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  46.08 
 
 		 892 aa  796    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  48.56 
 
 		 910 aa  837    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  48.56 
 
 		 910 aa  838    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  45.07 
 
 		 885 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  44.55 
 
 		 901 aa  687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 		 861 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 861 aa  646    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 874 aa  680    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 861 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.7 
 
 		 859 aa  771    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 868 aa  701    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 		 867 aa  656    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 		 871 aa  691    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 840 aa  686    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 		 857 aa  721    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  43.73 
 
 		 854 aa  712    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 		 852 aa  686    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 862 aa  648    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.88 
 
 		 857 aa  738    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 889 aa  740    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.08 
 
 		 868 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>