68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0731 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 719 aa  1494    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  52.6 
 
 		 462 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  54.61 
 
 		 322 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  48.91 
 
 		 728 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  48.29 
 
 		 614 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  50.22 
 
 		 210 aa  250  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  40.2 
 
 		 754 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  30.55 
 
 		 747 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  28.8 
 
 		 302 aa  122  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  29.2 
 
 		 617 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  28.51 
 
 		 442 aa  116  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  27.86 
 
 		 750 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  29.29 
 
 		 858 aa  113  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  27.24 
 
 		 562 aa  94.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  25.75 
 
 		 647 aa  94  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1474  hypothetical protein  59.42 
 
 		 81 aa  89  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  32.41 
 
 		 397 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  21.45 
 
 		 640 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  25.4 
 
 		 632 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  23.03 
 
 		 465 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  21.68 
 
 		 632 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  22.74 
 
 		 629 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  22.74 
 
 		 629 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  22.63 
 
 		 589 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  23.41 
 
 		 619 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  35.29 
 
 		 596 aa  72  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  26.1 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  26.1 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  26.1 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  22.82 
 
 		 404 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  24.57 
 
 		 671 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  27.43 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  32.17 
 
 		 423 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  26.33 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  29 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  43.02 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  36.19 
 
 		 361 aa  63.9  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  27.38 
 
 		 647 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  25.34 
 
 		 590 aa  63.9  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  27.87 
 
 		 467 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  27.64 
 
 		 598 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  27.43 
 
 		 660 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  32.31 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  24.15 
 
 		 529 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2323  penicillin binding protein  54.69 
 
 		 72 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  33.04 
 
 		 750 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  21.6 
 
 		 557 aa  60.1  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  33.93 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  30.99 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  27.62 
 
 		 631 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  23.95 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  32.69 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  25.19 
 
 		 700 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  26.7 
 
 		 413 aa  54.7  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  25.96 
 
 		 631 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  34.52 
 
 		 477 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2060  hypothetical protein  35.9 
 
 		 205 aa  51.6  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.252771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  26.46 
 
 		 465 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  31.87 
 
 		 447 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  27.66 
 
 		 515 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  27.2 
 
 		 621 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  28 
 
 		 563 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  38.67 
 
 		 596 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  25.48 
 
 		 664 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  27.66 
 
 		 601 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  24.9 
 
 		 672 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  24.65 
 
 		 649 aa  43.9  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>