More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0673 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.34 
 
 
697 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.96 
 
 
708 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.05 
 
 
756 aa  843    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
695 aa  1426    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.35 
 
 
693 aa  648    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.05 
 
 
698 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.89 
 
 
699 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.48 
 
 
698 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.07 
 
 
693 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.44 
 
 
698 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.93 
 
 
691 aa  610  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.5 
 
 
691 aa  598  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.33 
 
 
697 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.22 
 
 
691 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.71 
 
 
698 aa  508  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.51 
 
 
706 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.69 
 
 
718 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.5 
 
 
723 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.81 
 
 
788 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.98 
 
 
724 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.17 
 
 
745 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.51 
 
 
713 aa  495  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
689 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.45 
 
 
729 aa  495  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.5 
 
 
712 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  40.86 
 
 
691 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.6 
 
 
691 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.6 
 
 
691 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.31 
 
 
691 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.83 
 
 
704 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.9 
 
 
979 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.86 
 
 
749 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.06 
 
 
733 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.46 
 
 
754 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.53 
 
 
708 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.23 
 
 
734 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.5 
 
 
766 aa  458  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.74 
 
 
756 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.83 
 
 
712 aa  452  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.6 
 
 
714 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.68 
 
 
706 aa  446  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.72 
 
 
762 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.17 
 
 
679 aa  432  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.24 
 
 
741 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.22 
 
 
706 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.25 
 
 
448 aa  283  6.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.85 
 
 
602 aa  242  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.33 
 
 
646 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.14 
 
 
588 aa  233  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.8 
 
 
705 aa  230  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.8 
 
 
705 aa  230  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  36.8 
 
 
705 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  36.8 
 
 
705 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.87 
 
 
705 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.87 
 
 
705 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.8 
 
 
705 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.36 
 
 
706 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.44 
 
 
705 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.55 
 
 
1376 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.85 
 
 
705 aa  223  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.61 
 
 
705 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.29 
 
 
543 aa  220  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.06 
 
 
731 aa  219  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.85 
 
 
543 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.85 
 
 
543 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.71 
 
 
606 aa  217  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.7 
 
 
625 aa  217  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.4 
 
 
615 aa  217  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 
607 aa  216  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.68 
 
 
613 aa  216  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 
725 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 
607 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.86 
 
 
709 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 
709 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.86 
 
 
709 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.37 
 
 
592 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  34.82 
 
 
504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.94 
 
 
592 aa  214  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.27 
 
 
606 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 
607 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 
607 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 
593 aa  213  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.99 
 
 
716 aa  213  7.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 
593 aa  213  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.65 
 
 
607 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
718 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.93 
 
 
607 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.5 
 
 
607 aa  212  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 
451 aa  212  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.24 
 
 
626 aa  211  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.22 
 
 
737 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.93 
 
 
607 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.93 
 
 
607 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.93 
 
 
607 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.62 
 
 
535 aa  211  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.78 
 
 
602 aa  211  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.89 
 
 
615 aa  210  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.84 
 
 
729 aa  210  7e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.17 
 
 
617 aa  210  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.46 
 
 
602 aa  210  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>