More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1867 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  74.26 
 
 		 212 aa  310  9e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  70.3 
 
 		 214 aa  290  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  57.28 
 
 		 213 aa  235  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  59.42 
 
 		 206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  57.42 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  57.14 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  57.42 
 
 		 213 aa  228  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  57.42 
 
 		 209 aa  227  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  57.21 
 
 		 209 aa  225  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  57.69 
 
 		 216 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 207 aa  224  8e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  55.56 
 
 		 205 aa  224  9e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  56.65 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  56.81 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  56.73 
 
 		 222 aa  221  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  57.14 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  54.9 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  54.9 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  55.67 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  57.75 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  53.3 
 
 		 211 aa  218  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  53.55 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  55.24 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 210 aa  214  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 		 218 aa  215  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 210 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 210 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  54.11 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  53.77 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  52.83 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  53.77 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  52.58 
 
 		 212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  54.07 
 
 		 211 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 209 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 211 aa  210  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  56.34 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  54.07 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  53.81 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  53.88 
 
 		 226 aa  207  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  53.33 
 
 		 219 aa  207  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 209 aa  206  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  55.39 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  53.62 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  50.94 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  52.8 
 
 		 218 aa  205  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  52.61 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  53.52 
 
 		 211 aa  204  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  53.52 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 211 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 211 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  54.07 
 
 		 221 aa  204  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  57.49 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 205 aa  204  8e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  50.7 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  52.38 
 
 		 208 aa  204  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  52.61 
 
 		 212 aa  204  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  56.04 
 
 		 204 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  53.05 
 
 		 218 aa  203  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  53.81 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  52.86 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  52.91 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  52.13 
 
 		 212 aa  201  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000354089  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 210 aa  201  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  51.18 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 211 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 214 aa  201  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>