More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3370 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  57.02 
 
 		 703 aa  758    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  100 
 
 		 674 aa  1398    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  47.37 
 
 		 653 aa  629  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  44.81 
 
 		 640 aa  581  1e-164  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  45.04 
 
 		 660 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  41.81 
 
 		 662 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  47.98 
 
 		 704 aa  495  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  49.67 
 
 		 656 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  39.97 
 
 		 673 aa  481  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  37.27 
 
 		 657 aa  466  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  46.39 
 
 		 619 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  42.23 
 
 		 599 aa  343  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39.34 
 
 		 587 aa  336  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  39.78 
 
 		 601 aa  334  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  38.24 
 
 		 588 aa  333  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  38.21 
 
 		 583 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.55 
 
 		 582 aa  327  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  39.64 
 
 		 595 aa  324  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  38.88 
 
 		 598 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  39.46 
 
 		 601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  39.78 
 
 		 598 aa  320  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  39.78 
 
 		 598 aa  320  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  39.78 
 
 		 598 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  39.78 
 
 		 598 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  39.78 
 
 		 598 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  39.78 
 
 		 598 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  39.78 
 
 		 571 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  39.78 
 
 		 598 aa  319  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  39.78 
 
 		 598 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  39.15 
 
 		 600 aa  317  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  38.43 
 
 		 598 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.75 
 
 		 587 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  40.18 
 
 		 604 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.15 
 
 		 660 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  40.29 
 
 		 638 aa  310  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  40.91 
 
 		 660 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  40.91 
 
 		 660 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.15 
 
 		 660 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.05 
 
 		 663 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.6 
 
 		 600 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  41.43 
 
 		 664 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  39.86 
 
 		 652 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  37 
 
 		 632 aa  307  5.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  42.19 
 
 		 576 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.14 
 
 		 651 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.73 
 
 		 660 aa  303  7.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  39.14 
 
 		 655 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  39.42 
 
 		 614 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.39 
 
 		 626 aa  301  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.73 
 
 		 663 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  37.84 
 
 		 617 aa  300  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  41.91 
 
 		 645 aa  300  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.38 
 
 		 588 aa  298  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 604 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  36.24 
 
 		 636 aa  297  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  39.02 
 
 		 686 aa  296  6e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  38.96 
 
 		 609 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.77 
 
 		 599 aa  293  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  39.38 
 
 		 578 aa  293  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.28 
 
 		 613 aa  292  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  41.65 
 
 		 595 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  38.89 
 
 		 604 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  41.42 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  38.58 
 
 		 684 aa  291  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  39.39 
 
 		 581 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  38.39 
 
 		 666 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  36.95 
 
 		 632 aa  290  7e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  39.39 
 
 		 581 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  39.39 
 
 		 581 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  39.39 
 
 		 581 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  35.05 
 
 		 631 aa  290  8e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  39.39 
 
 		 581 aa  290  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  35.41 
 
 		 633 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  41.24 
 
 		 593 aa  288  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  36.58 
 
 		 576 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  36.87 
 
 		 630 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  42.25 
 
 		 584 aa  287  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  41.46 
 
 		 656 aa  287  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  39.84 
 
 		 539 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  37.11 
 
 		 682 aa  286  8e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  41.03 
 
 		 582 aa  286  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  38.68 
 
 		 585 aa  286  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.49 
 
 		 694 aa  286  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.8 
 
 		 613 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  41.97 
 
 		 584 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  36.52 
 
 		 614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  41.3 
 
 		 582 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  41.3 
 
 		 582 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  41.3 
 
 		 582 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  38.69 
 
 		 573 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  41.42 
 
 		 652 aa  281  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  40.76 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  41.69 
 
 		 584 aa  282  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  40.76 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  40.85 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  40.85 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  39.27 
 
 		 576 aa  280  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.33 
 
 		 676 aa  280  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  38.5 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  37.89 
 
 		 574 aa  280  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>