More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2943 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  75.23 
 
 		 219 aa  347  8e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  58.02 
 
 		 221 aa  268  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.26 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.65 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.8 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.65 
 
 		 456 aa  137  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 456 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.92 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.4 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.19 
 
 		 456 aa  132  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  34.55 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.7 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  33.98 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.65 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  32.21 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.84 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  32.04 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.14 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.69 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  32.55 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.13 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  29.25 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  29.77 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.21 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.33 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.56 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  34.03 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.9 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  33.87 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  30.14 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.17 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.1 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31.49 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  29.73 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  28.16 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  25.56 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.63 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 242 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  34.52 
 
 		 219 aa  95.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  31.87 
 
 		 195 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.19 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.43 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  28.17 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  28.27 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.06 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.57 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  32.06 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.18 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  34.27 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  27.7 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  35.29 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  28.88 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 396 aa  91.7  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.24 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  28.42 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  26.99 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.24 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  27.18 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.08 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.93 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.47 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  34.87 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  30.19 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  31.52 
 
 		 223 aa  88.2  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.61 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  31.55 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  26.82 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  31.52 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  32.68 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.78 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.78 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  30.77 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40332  predicted protein  30.33 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.5 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  29.35 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.89 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>