73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1584 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  38.35 
 
 		 221 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  38.35 
 
 		 221 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  38.81 
 
 		 232 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  35.61 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.12 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  31.47 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.6 
 
 		 175 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  29.85 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  29.85 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.64 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  28.79 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  32.86 
 
 		 169 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  33.58 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  33.33 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  27.27 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  32.59 
 
 		 244 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.89 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  35.07 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  28.17 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30.34 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  28.17 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  29.55 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  29.55 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  29.85 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02380  transcription factor, putative  31.91 
 
 		 946 aa  56.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.510598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  26.67 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  30.08 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  27.59 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.94 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  33.58 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  24.83 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  27.7 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  29.71 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  28.89 
 
 		 227 aa  52  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  25.36 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  26.52 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  29.85 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  28.26 
 
 		 233 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  28.78 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  25.55 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  29.1 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.85 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  29.93 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  26.43 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  30.08 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  25 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  27.68 
 
 		 205 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  30.08 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  26.32 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  26.12 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  28.37 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  33.09 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  32.33 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  26.67 
 
 		 183 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  30.6 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0403  nuclease (SNase domain protein)  22.5 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  29.46 
 
 		 214 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  32.06 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  26.52 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  29.23 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  25.49 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  28.68 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  25 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  28.36 
 
 		 333 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  31.31 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  25.52 
 
 		 193 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>