14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0403 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0403  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  26.21 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  25.52 
 
 		 221 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  27.33 
 
 		 232 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  24.65 
 
 		 244 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.8 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  25.19 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  34.65 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  22.5 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  20.17 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  31.3 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  21.68 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  28.23 
 
 		 161 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  25.32 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>