More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2579 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2579  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 311 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1094  LysR family transcriptional regulator  78.78 
 
 		 317 aa  522  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0050  LysR family transcriptional regulator  62.46 
 
 		 311 aa  431  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.142799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1327  LysR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 311 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.893209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2831  LysR family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 312 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1545  transcriptional regulator, LysR family  60.13 
 
 		 312 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.813324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2956  LysR family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 312 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2813  LysR family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 312 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3767  LysR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3581  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0491  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2614  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00915901  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0465  LysR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  35.55 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  34.95 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0225  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2131  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0617506  normal  0.31287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1861  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11490  Transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1471  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3853  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0876219  normal  0.133098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3995  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000135296  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1436  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.634744  normal  0.320614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2408  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0423159  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 289 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.39 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  32.99 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1277  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.927239  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  32.52 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  35.2 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15310  transcriptional regulatory protein, LysR family  34.98 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.313751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  32.53 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4691  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.48 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  33.22 
 
 		 288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3033  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0273235  normal  0.89504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2307  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  32.01 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0915  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3906  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>