More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2704 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  100 
 
 		 404 aa  828    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  68.98 
 
 		 404 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  64.52 
 
 		 404 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  64.6 
 
 		 462 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  65 
 
 		 404 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  60.89 
 
 		 405 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  61.88 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  60.5 
 
 		 407 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  56.75 
 
 		 400 aa  477  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  55.85 
 
 		 420 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  55.06 
 
 		 406 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  53.66 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  57 
 
 		 403 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  56.82 
 
 		 406 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  55.06 
 
 		 411 aa  434  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  53.3 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  55.61 
 
 		 378 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  54.66 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  51.72 
 
 		 410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  51.49 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  50.25 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  48.58 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  48.21 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  51.12 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  50.25 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  48.89 
 
 		 409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  42.96 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  45.39 
 
 		 412 aa  341  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  46.02 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  59.34 
 
 		 276 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  44.95 
 
 		 428 aa  339  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  45.7 
 
 		 412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  42.96 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  46.42 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  43.62 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  42.53 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  44.58 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  43.13 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  43.78 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  40.4 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  40.15 
 
 		 404 aa  311  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  44.03 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  42.36 
 
 		 413 aa  310  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  39.85 
 
 		 404 aa  309  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  40.4 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  39.6 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  39.6 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  39.24 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  42.31 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  41.65 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  43.69 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  40.8 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  42.17 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  40.46 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  40.29 
 
 		 404 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  40.8 
 
 		 404 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  40.8 
 
 		 404 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  41.28 
 
 		 410 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  41.18 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  41.65 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  39.24 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  39.85 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  39.24 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0676  phage integrase family site specific recombinase  49.67 
 
 		 303 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.825642  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  41.52 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  39.95 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  40.77 
 
 		 387 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  40.1 
 
 		 419 aa  289  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  39.95 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  40.1 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  40 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  39.49 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  38.17 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  39.19 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  37.6 
 
 		 396 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  38.92 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  41.16 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  37.66 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  38.37 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  38.37 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  39.26 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  39.31 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.4 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  38.61 
 
 		 420 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.11 
 
 		 402 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.4 
 
 		 394 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  40.97 
 
 		 399 aa  275  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  39.75 
 
 		 401 aa  275  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  37.08 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  38.07 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  40 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  37.32 
 
 		 411 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  38.17 
 
 		 394 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.12 
 
 		 420 aa  272  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3377  phage integrase family protein  41.45 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.53 
 
 		 422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  37.53 
 
 		 419 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  39.66 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  36.63 
 
 		 421 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  38.48 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>