More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2173 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  316  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  77.42 
 
 
159 aa  251  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  77.42 
 
 
155 aa  249  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  48.98 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  48.98 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 
159 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 
159 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
159 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 
161 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 
186 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
153 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 
158 aa  134  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  43.23 
 
 
155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  48.61 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  46.26 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  43.05 
 
 
151 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.54 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 
162 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
159 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 
162 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  41.72 
 
 
160 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
174 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
188 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
174 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
154 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5249  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
166 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.615663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 
162 aa  120  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
162 aa  120  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
167 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
174 aa  120  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4523  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
160 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
157 aa  117  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
156 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  35.48 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.06 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  39.49 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
155 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
155 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
157 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
155 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
155 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
160 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  37.42 
 
 
156 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
164 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
156 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
174 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  35.81 
 
 
157 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  35.81 
 
 
157 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 
159 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
156 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
153 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  41.84 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>