77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1209 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  42.11 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  42.11 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  32.76 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  46.88 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  33.62 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0049  XRE family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1184  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  39.24 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  37.97 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  41.27 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 107 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  45.9 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  45.9 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  21.17 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  21.36 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  34.72 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  35.96 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 113 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  42.86 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 107 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 107 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  25.4 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 107 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1025  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 104 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  44.64 
 
 		 135 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1044  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 104 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0449357  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  44.64 
 
 		 135 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1563  transcriptional regulator, XRE family  30.63 
 
 		 135 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4050  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 307 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  30.21 
 
 		 107 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  40.32 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  30.21 
 
 		 107 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 107 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 107 aa  44.7  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  30.21 
 
 		 107 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  30.21 
 
 		 107 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  38.81 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  30.21 
 
 		 107 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  30.21 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3242  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  30.21 
 
 		 107 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4140  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 307 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3268  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 104 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  44.64 
 
 		 347 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0763  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 109 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.042345  normal  0.213229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 131 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  36.21 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  31.88 
 
 		 131 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.06 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  36.51 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  30.95 
 
 		 273 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  43.64 
 
 		 131 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 122 aa  42.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  46.43 
 
 		 270 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 244 aa  42  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 191 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 134 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 189 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4834  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 135 aa  41.6  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6290  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 121 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  41.38 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3522  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  41.2  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 80 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2429  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  41.2  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>