36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0763 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0763  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  223  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.042345  normal  0.213229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1184  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2989  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3898  helix-turn-helix domain-containing protein  46.51 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4444  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  40.54 
 
 		 233 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  40.54 
 
 		 233 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  40.54 
 
 		 233 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4120  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  35.23 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8816  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809895  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  47.73 
 
 		 118 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  34.83 
 
 		 243 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3957  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010777  normal  0.26793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02750  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.92 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.96581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0033  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.656945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  51.35 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  44.19 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2833  hypothetical protein  44.12 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  46.51 
 
 		 436 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 104 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>