More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2886 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.13 
 
 		 254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 		 256 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.78 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.91 
 
 		 259 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 		 255 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.92 
 
 		 254 aa  275  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.44 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  53.15 
 
 		 254 aa  272  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 		 253 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 		 253 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.44 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 		 259 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.97 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.37 
 
 		 269 aa  249  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.02 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  55.69 
 
 		 256 aa  248  9e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 		 250 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.76 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  47.79 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.1 
 
 		 194 aa  224  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  46.18 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 		 277 aa  205  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  43.9 
 
 		 247 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.08 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  42.04 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  42.04 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  42.04 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  42.04 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 246 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  41.3 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  37.55 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 248 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>